Varijabilnost mitohondrijske DNA goveda (CROSBI ID 415398)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Duvnjak, Ivana
Čubrić Čurik, Vlatka
Brajković, Vladimir
hrvatski
Varijabilnost mitohondrijske DNA goveda
Uloga divljeg tura (B. primigenius) tijekom domestikacijskih procesa te utjecaj na formiranje domesticiranih i modernih pasmina goveda (B. taurus) nije do kraja razjašnjena. Postoje teorije prema kojima sve moderne pasmine goveda imaju jedinstveno podrijetlo s Bliskog istoka i nastale su domestikacijom populacije divljeg tura s tog područja te teorije prema kojima su one nastale tijekom više nezavisnih lokalnih domestikacijskih procesa uz introgresiju divljeg tura te uz dotok gena sjevernoafričkih goveda u područje južne Europe. Cilj ovog rada je rekonstrukcijom distribucije varijabilnosti mtDNA modernih pasmina i arheo- uzoraka u prostoru i vremenu dodatno razjasniti utjecaj divljeg tura na formiranje modernih pasmina. U analizi je korišteno ukupno 635 nukleotidnih sljedova kontrolne regije mtDNA duljine 237 bp iz NCBI baze podataka te iz uzoraka prikupljenih i analiziranih u ovom radu. Analiza i obrada nukleotidnih sljedova odrađena je putem programa MEGA7, DNasp5 i Mitotoolpy, a vizualizacija distribucije varijabilnosti i filogenetskih odnosa putem MJ mreže u PopArtu. Rezultati su pokazali veliku varijabilnost mtDNA kod goveda te porast varijabilnosti kroz vrijeme. Analizom haplogrupa utvrđeno je postojanje svih glavnih haplogrupa u odabranim uzorcima te su određene nepoznate haplogrupe za odabrane arheouzorke. Potvrđen je i utjecaj gena iz područja sjeverne Afrike na formiranje južnoeuropskih modernih pasmina goveda. Analizom geografske rasprostranjenosti utvrđene su tri moguće lokacije nezavisne domestikacije iz kojih su domesticirana goveda mogla migrirati. Tijekom migracije moglo je doći do introgresije lokalnih populacija divljeg tura. Za preciznije i točnije određivanje filogeneze modernih pasmina goveda i tijek domestikacije potrebno je u analize uključiti druge regije mtDNA, različite utjecaje kojima su one podložne (npr. selekciji), utjecaj molekularnog sata, datiranje arheo-uzoraka te koristiti dostupne nove tehnologije.
domestikacija goveda, kontrolna regija mtDNA, varijabilnost, MJ mreža, haplogrupe
nije evidentirano
engleski
Variability of mitochondrial DNA cattle
nije evidentirano
cattle domestication, mtDNA control region, variability, MJ network, haplogroups
nije evidentirano
Podaci o izdanju
51
10.07.2017.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Agronomski fakultet
Zagreb