Utjecaj veličine uzoraka na procjenu "linkage disequilibrium efektivne veličine" u populacijama goveda (CROSBI ID 415276)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Krapandža, Nina
Čurik, Ino
Ferenčaković, Maja
hrvatski
Utjecaj veličine uzoraka na procjenu "linkage disequilibrium efektivne veličine" u populacijama goveda
Efektivna veličina populacije (Ne) centralni je koncept u konzervacijskoj genetici. S obzirom na to da je iskustvo pokazalo kako su procjene temeljene na rodovniku često neprecizne, zbog nedostatnih i pogreš nih rodovnika i stohastičke prirode rekombinacije, za procjenu se koriste nove metode. Visoko -rezolutna genomska informacija kao najpolimorfnija informacija do sada, pokazala se puno preciznijom. Precizna procjena efektivne veličine populacije od velike je važnosti, posebice kada se za procjene koriste uzorci malih veličina. Najčešće korištena procjena je ona bazirana na „linkage disequilibrium-u“ (LD). Ovaj rad prikazuje kako koristeći osnovne postavke računalnog programa SNeP pri izračunima variraju vrijednosti Ne u odnosu na veličinu uzorka. Rezultati otkrivaju značajne razlike u procijenjenim NeLD pri veličinama uzoraka 10, 20, 30, (...), 100. Iako je navedena problematika relativno novijeg vijeka postoji nekoliko formula za korekciju, međutim ostaje pitanje koja je ona prava, te je nužno provoditi daljnja istraživanja kako bi se problem pristranosti riješio.
efektivna veličina populacije, veličina uzorka, linkage desequilibrium, SNep
nije evidentirano
engleski
Effect of Sample Size on Estimation of "effective linkage of disequilibrium Size" in Bovine Populations
nije evidentirano
effective population size, sample size, linkage disequilibrium, SNp
nije evidentirano
Podaci o izdanju
40
27.09.2016.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Agronomski fakultet
Zagreb