hrvatski

Karakterizacija aktivnog mjesta i interakcija kvaščeve seril-tRNA-sintetaze sa staničnim makromolekulama

Aminoacil-tRNA-sintetaze su esencijalni enzimi koji kataliziraju vezanje aminokisleine na tRNA uz utrošak ATP. Studija aktivnog mjesta seril-tRNA-sintetaze iz kvasca Saccharomyces cerevisiae pokazala je da petlja motiva 2, konzerviranog slijeda u svim seril-tRNA-sintetazama, sudjeluje u vezanju supstrata i u kvaščevom enzimu. Kinetička anliza SerRS mutiranih u toj regiji pokazala je smanjenje afiniteta (povišen Km) za serin i ATP, uz smanjenu katalitički konstantu kcat. Usporedbom reakcija provedenih bez tRNA (aktivacija aminokiseline)i uz tRNA (aminoaciliranje), zaključeno je da kvaščeva SerRS pokazuje tRNA-ovisno vezanje aminokiseline. Taj mehanizam doprinosi specifičnosti reakcije te sprečava aktivaciju aminokiseline u nedostaku tRNA. Također, interakcija sintetaza s drugim proteinima u stanici doprinosi procesivnosti i specifičnosti aminoaciliranja. Upotrebom sustava dvaju hibrida identificiran je Pex21p, protein koji ostvaruje specifične interakcije s kvaščevom SerRS. Pex21p sudjeluje u biogenezi peroksisoma, međutim njegovim nedostatkom ne remeti se biogeneza, te se čini da je interakcija sa SerRS druga važna funkcija ovog proteina. U tom slučaju, pek21p može djelovati kao chaperon ili kofaktor u procesima koji prethode biosintezi proteina na ribosomu. Zaključno, tRNA-ovisno prepoznavanje aminokiseline kontrolni je mehanizam koji doprinosi kvaliteti translacije proteina. Biološko značenje interakcije SerRS s Pex21p treba tražiti u istom kontekstu.

aminoacyl-tRNA-sintetaze; tRNA; proteinske interakcije; sustav dvaju hibrida; translacija proteina

nije evidentirano