engleski

Diversity of biofilm microbial communities in the subterranean ecosystem: Markov ponor, Lipovo polje

U posljednje je vrijeme brojnim istraživanjima pokazano da krški sustavi u Dinaridima sadrže podzemna staništa iznimne bioraznolikosti. Istraživanja su bila većim dijelom fokusirana na podzemne beskralježnjake, osobito člankonošce. Međutim, važna karika u ekološkim odnosima podzemlja su mikrobne zajednice, čiji je značaj u oligotrofnim podzemnim ekosustavima većim dijelom neistražen. Iako temperatura malo varira kroz godinu, u mnogim podzemnim sustavima dolazi do variranja u količini vode te su vjerojatno ciklusi plavljenja i isušivanja dominantan ekološki čimbenik za podzemne mikrobne zajednice. Stoga je osnovni cilj ovog rada bio istražiti kako količina vode utječe na sastav obraštajnih mikrobnih zajednica (biofilma) u krškom podzemlju. Uzorci su sakupljeni na suhom i vlažnom mikrostaništu u Markovom ponoru (Lipovo polje, Hrvatska). Uzeti obrisci mikroorganizama nasađeni su na neselektivne hranjive podloge (Tryptic Soy Agar). Taksonomska identifikacija pojedinačnih bakterijskih izolata učinjena je MALDI-TOF masenom spektrometrijom i sekvencioniranjem 16S rDNA amplikona. Uzgojene su bakterije iz rodova Bacillus, Lysinibacillus, Paenibacillus, Exiguobacterium i Pseudomonas. Neki od izolata, poput Bacillus thuringiensis i Paenibacillus amylolyticus su kozmopoliti, dok su drugi karakteristični za mineralne vode i izvorišna područja (npr. Pseudomonas mandelii i P. gessardii). Uspoređeni su rezultati masene spektrometrije i sekvenciranja te su izrađene filogenetske analize uzgojenih izolata temeljem 16S sekvenci. Dobiveni rezultati daju prva saznanja o mikrobnim zajednicama u Markovom ponoru te rasvjetljavaju utjecaj količine vode, kao dominantnog ekološkog faktora, na sastav uzgojenih mikroorganizama.

microbial communities, subterranean ecosystem, karst

nije evidentirano