hrvatski

Biološke i molekularne značajke Coleus blumei viroida 3

Viroidi su gole, prstenaste molekule RNA duge 246 – 401 nukleotida. Najmanje su autonomne infektivne nukleinske kiseline dosada poznate, ne kodiraju proteine, a isključivo su biljni patogeni. Plectranthus scutellarioides (L.) R. Br. (syn. Coleus blumei) ili šarena kopriva je domaćin nekoliko Coleus blumei viroida (CbVd). Šarena kopriva je široko rasprostranjena ukrasna biljka i domaćin za istraživanje roda Coleviroid (Pospiviroidae). Najbolje istraženi coleviroid je Coleus blumei viroid 1 (CbVd-1) dok se za CbVd-3 to ne može reći. Cilj ovog diplomskog rada je bio potvrditi inficiranost prethodno istraživanih kultivara šarene koprive viroidom CbVd-3 te istražiti njegove glavne molekularne i biološke značajke (krug domaćina, prijenos sjemenom, prijenos cijepljenjem). Iz ukupne RNA potencijalnih domaćina metodom reverzne transkripcije i lančane reakcije polimeraze (RT-PCR) detektirana je prisutnost viroida uz primjenu generičkih početnica za rod Coleviroid. Od istraženih potencijalnih alternativnih domaćina iz porodice Lamiaceae, jedino se Salvia hispanica L. pokazala kao mogući novi domaćin coleviroida. Transgeni korjenčići šarene koprive također su domaćini coleviroida koji u njima perzistira. Analiza parcijalnih sekvenci viroida iz S. hispanica i transgenih korjenčića šarene koprive ukazuje na CbVd-1 i potvrđuje njegov širi krug domaćina u odnosu na CbVd-3. Dokazana je prenosivost CbVd-3 sjemenom šarene koprive od 40%, no prijenos cijepljenjem nije bio uspješan. Zbog nedostatnih tehničkih uvjeta pokus cijepljenja bi trebalo ponoviti. Istraživanjem domaćina metodom sekvencijske poliakrilamidne gel-elektroforeze (sPAGE) za laboratorijski uzorak šarene koprive inficirana s CbVd-3 u smjesi s CbVd-1 infekcija je potvrđena.

Coleviroid, CbVd-1, CbVd-3, šarena kopriva, RT-PCR, sPAGE

nije evidentirano