Poboljšano sufiksno polje (CROSBI ID 407809)
Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad
Podaci o odgovornosti
Hadviger, Antea
Šikić, Mile
hrvatski
Poboljšano sufiksno polje
U bioinformatici često se javlja problem pretraživanja veoma dugačkih nizova (DNA sljedova) s različitim uzorcima pretrage. Kako bi se problem riješio u razumnom vremenu, potrebno je koristiti efikasne strukture indeksiranja teksta, kao što su sufiksno stablo i poboljšano sufiksno polje. Poboljšano sufiksno polje sastoji se od običnog sufiksnog polja i dodatnih struktura (polje najduljih zajedničkih prefiksa, tablica djece). Uz manje memorijsko zauzeće, jednostavniju implementaciju i linearno vrijeme izgradnje, koristeći algoritme kao što je SA-IS, u praksi nadmašuje sufiksno stablo zadržavajući svu kompleksnu funkcionalnost.
bioinformatika; poboljšano sufiksno polje; SA-IS
nije evidentirano
engleski
Enhanced suffix array
nije evidentirano
bioinformatics; enhanced suffix array; SA-IS
nije evidentirano
Podaci o izdanju
41
03.06.2015.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb