Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (l.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA bleomicinom (CROSBI ID 407753)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Rakušić, Mia
Šamanić, Ivica ; Puizina, Jasna
hrvatski
Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (l.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA bleomicinom
Protein Mre11, u okviru kompleksa Mre11-Rad50- Nbs1/Xrs2 (MRN/X), ima važnu ulogu u popravcima dvolančanih lomova DNA svih do sada istraživanih organizama, od bakterija do čovjeka. U cilju istraživanja te specifične uloge proteina Mre11 u biljne modelne vrste Arabidopsis thaliana (L.), uspoređena je ekspresija gena MRE11 i drugih gena staničnog odgovora, nakon izazivanja dvolančanih lomova DNA bleomicinom. Usporedna analiza ekspresije ciljanih gena urađena je kod mutantne liniji mre11-2 s insercijom T-DNA u 19. egzonu i kod biljaka divljeg tipa, ekotipova Columbia [Col- 0] i Wassilewskija [Ws]. Metodom RT-PCR ukupna biljna RNA prevedena je u cDNA koja je poslužila kao kalup za umnažanje gena metodom PCR. Umnoženi geni su potom naneseni na agarozni gel kako bi se mogla odrediti približna ekspresija tih gena kod različitih uzoraka. U mutanata mre11-2 tretiranih bleomicinom rezultati RT-PCR-a pokazali su smanjenu transkripciju gena CYCB1 ; 1, biljega faze G2/M staničnog ciklusa, te gena ključnih za popravak DNA (BRCA1, RAD51, PARP1), za razliku od povećane ekspresije tih gena kod biljaka divljeg tipa. Ekotipovi Columbia i Wassilewskija pokazuju podudaran obrazac ekspresije gena staničnog odgovora. Smanjena ekspresija gena staničnog odgovora u mutantnoj liniji Atmre11-2 potvrđuju važnost cjelovitosti Mre11 proteina za normalni odgovor stanice na dvolančane lomove DNA.
MRE11; mutant mre11-2; Arabidopsis thaliana; bleomicin; DSB
nije evidentirano
engleski
Expression of damage response genes in mre11-2 mutant line of Arabidopsis thaliana (l.) after inducing DNA double strand breaks with bleomycin treatment
nije evidentirano
MRE11; mutant mre11-2; Arabidopsis thaliana; bleomycin; DSB
nije evidentirano
Podaci o izdanju
51
28.09.2016.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu
Split