Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 832760

Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana


Zanki, Vladimir
Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana, 2016., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


CROSBI ID: 832760 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana
(Analysis of protein interactors of cytosolic seryl- tRNA synthetase from plant Arabidopsis thaliana)

Autori
Zanki, Vladimir

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
15.09

Godina
2016

Stranica
115 + XVI

Mentor
Rokov Plavec, Jasmina

Neposredni voditelj
Kekez, Mario

Ključne riječi
rekombinantna tehnologija DNA ; pročišćavanje proteina ; proteinske interakcije ; mikrotermoforeza ; seril-tRNA-sintetaza ; Arabidopsis thaliana
(recombinant DNA technology ; protein purification ; protein interactions ; microscale thermophoresis ; seryl-tRNA synthetase ; Arabidopsis thaliana)

Sažetak
Seril-tRNA-sintetaze (SerRS) su enzimi odgovorni za uspostavu kovalentne veze između pripadne tRNA i aminokiseline serin čime ostvaruju podlogu za ispravnu biosintezu proteina. Uz ovu kanonsku ulogu, SerRS proteini imaju i nekanonske uloge koje ostvaruju samostalno ili uspostavljajući interakcije s drugim staničnim proteinima. U sklopu ovog rada, za potrebe biofizičkih mjerenja pripremljeni su prethodno identificirani potencijalni interakcijski partneri citosolne SerRS iz biljke Arabidopsis thaliana i to glutation-S-transferaza phi 2 (GSTF2) i protein do sada nepoznate funkcije (PNF), dok je kodirajući slijed za ribosomski protein L9 uspješno ugrađen u plazmidne vektore. Nadalje, u svrhu određivanja interakcijskog sučelja citosolne SerRS i nedavno otkrivenog interakcijskog partnera, proteina BEN1 uključenog u metabolizam brasinosteroidnih hormona, osmišljene su i pripremljene skraćene varijante navedenih proteina. Mikrotermoforetska mjerenja pokazala su da citosolna SerRS uspostavlja interakciju s proteinom BEN1 svojom središnjom, katalitičkom domenom, dok protein BEN1 za interakciju s proteinom SerRS koristi nestrukturirani hidrofilni produžetak na N-kraju. Također je pokazana i važnost GST-privjeska koji značajno poboljšava prinos i stabilnost katalitičke domene citosolne SerRS.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija



POVEZANOST RADA


Projekti:
HRZZ-09.01/293 - Nekanonske uloge aminoacil-tRNA-sintetaza (Weygand Đurašević, Ivana; Gruić Sovulj, Ita, HRZZ - „Istraživački projekti“, 2. rok 28.10.2011.,) ( POIROT)

Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Profili:

Avatar Url Vladimir Zanki (autor)

Avatar Url Mario Kekez (mentor)

Avatar Url Jasmina Rokov Plavec (mentor)

Citiraj ovu publikaciju:

Zanki, Vladimir
Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana, 2016., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zanki, V. (2016) 'Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana', diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Zanki, Vladimir}, year = {2016}, pages = {115 + XVI}, keywords = {rekombinantna tehnologija DNA, pro\v{c}i\v{s}\'{c}avanje proteina, proteinske interakcije, mikrotermoforeza, seril-tRNA-sintetaza, Arabidopsis thaliana}, title = {Analiza proteinskih interakcija citosolne seril- tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana}, keyword = {rekombinantna tehnologija DNA, pro\v{c}i\v{s}\'{c}avanje proteina, proteinske interakcije, mikrotermoforeza, seril-tRNA-sintetaza, Arabidopsis thaliana}, publisherplace = {Zagreb} }
@phdthesis{phdthesis, author = {Zanki, Vladimir}, year = {2016}, pages = {115 + XVI}, keywords = {recombinant DNA technology, protein purification, protein interactions, microscale thermophoresis, seryl-tRNA synthetase, Arabidopsis thaliana}, title = {Analysis of protein interactors of cytosolic seryl- tRNA synthetase from plant Arabidopsis thaliana}, keyword = {recombinant DNA technology, protein purification, protein interactions, microscale thermophoresis, seryl-tRNA synthetase, Arabidopsis thaliana}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font