hrvatski

Poravnanje RNA očitanja na poznate gene

RNA sekvenciranje je metoda za analizu transkriptoma. Analizom transkriptoma u nekom trenutku dobivamo uvid u stanje organizma i mogucnost identificiranja regija genoma koje su odgovorne za razlicite funkcije. U ovom radu je prikazano proširenje alata GraphMap u svrhu poravnanja RNA ocitanja na poznate gene. Osim toga, opisani su osnovni mehanizmi u sekvenciranju nanoporama, te neke druge tehnologije korištene za sekvenciranje i poravnanje. Dan je i pregled formata datoteka koje su korištene za spremanje anotacija eksonski regija, spremanje genoma i transkriptoma i spremanje podataka o poravnanjima.

RNA; poravnanje; GraphMap; gen; genom; transkriptom; nanopore

nije evidentirano