Detaljna analiza bakterijske raznolikosti Jadranskoga mora (CROSBI ID 395526)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Korlević, Marino
Orlić, Sandi
hrvatski
Detaljna analiza bakterijske raznolikosti Jadranskoga mora
Bakterije u morskim ekosustavima predstavljaju morfološki, genetički te funkcionalno vrlo raznovrsnu skupinu mikroorganizama. Primjenom 454 pirosekvenciranja gena za 16S rRNA i fluorescencijske in situ hibridizacije kataliziranim taloženjem reportera određena je sezonska dinamika bakterijskih zajednica u otvorenom moru južnog i sjevernog Jadrana, te estuarija rijeke Krke. Brojnost bakterijskih operativnih taksonomskih jedinica i struktura zajednice u svim istraživanim područjima bile su pod utjecajem hidrografskih uvjeta. U južnom Jadranu snažan utjecaj imale su zimsko duboko miješanje vodenog stupca i ingresija Levantinske intermedijarne vode, u sjevernom Jadranu sezonski uvjeti okoliša te protok rijeke Po, a u estuariju rijeke Krke protok rijeke i snažan gradijent saliniteta. Prokariotskim pikoplanktonskim zajednicama Jadranskoga mora dominira klad SAR11 čiji je udio u zajednici bio najveći u oligotrofnom području južnog Jadrana. Razred Betaproteobacteria pojavljivao se u područjima pod utjecajem riječne vode. Predstavnici koljena Actinobacteria pojavljivali su se u svim istraživanim područjima, međutim jedino im je u riječnoj vodi estuarija rijeke Krke brojnost bila povećana sa snažno izraženom sezonalnošću. Morske skupine NS4 i NS5 koljena Bacteroidetes uz klad SAR86 razreda Gammaproteobacteria identificirane su kao podskupine koje su se pojavljivale tijekom fitoplanktonskih cvatova u svim istraživanim područjima. Cijanobakterijske zajednice Jadranskog mora činili su tipični morski rodovi Synechococcus i Prochlorococcus. Povećana prisutnost roda Prochlorococcus detektirana je jedino u južnom Jadranu dok je u sjevernom Jadranu dominirao rod Synechococcus. Tipične dubokooceanske skupine SAR324, SAR202 i SAR406 uz povećanu brojnost arheja karakterizirale su duboke vode Jadrana.
raznolikost bakterija ; pikoplankton ; Jadransko more ; 454 pirosekvenciranje ; CARD-FISH
nije evidentirano
engleski
In-depth analysis of the Adriatic Sea bacterial diversity
nije evidentirano
bacterial diversity ; picoplankton ; Adriatic Sea ; 454 pyrosequencing ; CARD-FISH
nije evidentirano
Podaci o izdanju
106
15.06.2015.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb