Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 756523

Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1


Ines Tomić
Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1, 2015., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split


CROSBI ID: 756523 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1
(The influence of substrate binding on fluorescence properties of the adenylation domain in tyrocidine synthetase 1)

Autori
Ines Tomić

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Split

Datum
26.03.2015

Godina
2015

Stranica
30+V

Mentor
Pavela-Vrančić Maja

Neposredni voditelj
Šprung Matilda

Ključne riječi
neribosomske peptid-sintetaze/ adenilacijska domena/ tirocidin-sintetaza 1/ strukturna dinamika
(nonribosomal peptide synthetases/ adenylation domain/ tyrocidine synthetase 1/ structural dynamics)

Sažetak
Neribosomske peptid-sintetaze (NRPS) su veliki multienzimski kompleksi koji kataliziraju sintezu različitih medicinski značajnih peptidinih spojeva. Proces biosinteze započinje na adenilacijskoj (A) domeni koja u prvom koraku katalizira nastanak aminoacil- adenilata, dok se u drugom koraku odvija prijenos aktivirane aminokiseline na susjednu tiolacijsku (T) domenu. U ovom radu, strukturna dinamika A-domene tirocidin-sintetaze 1 (TycA-A) ispitana je metodom fluorescencijske spektroskopije. Aminokiselinski slijed TycA-A proteina sadrži pet triptofanskih ostataka: W227, W301, W323, W376 i W406. Gašenjem fluorescencije divljeg tipa i mutanti TycA-A akrilamidom, definirane su dvije skupine triptofana s različitim stupnjem dostupnosti njihovih bočnih ogranaka okolnom otapalu. Prisustvo supstrata (L-Phe i ATP) induciralo je konformacijsku promjenu proteinu divljeg tipa i svim mutantama, osim W227F. Naime, konformacijska promjena proteina, nastala kao posljedica vezanja supstrata, izostaje ukoliko se triptofan na položaju 227 zamijeni fenilalaninom. To upućuje na zaključak da je promjena konformacije proteina, lokalizirana upravo oko ovog triptofanskog ostatka. Gašenje fluorescencije proteina TycA-A kalijevim jodidom, zajedno s analizom učinkovitosti pojedinih molekula gasitelja, pokazuje kako je akrilamid u usporedbi s KI učinkovitiji gasitelj.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija



POVEZANOST RADA


Projekti:
177-0000000-2962 - Oligomerni enzimski sustavi u sintezi bioaktivnih sekundarnih metabolita (Pavela-Vrančić, Maja, MZOS ) ( POIROT)

Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Split

Profili:

Avatar Url Matilda Šprung (mentor)

Avatar Url Maja Pavela-Vrančić (mentor)

Poveznice na cjeloviti tekst rada:

Pristup cjelovitom tekstu rada

Citiraj ovu publikaciju:

Ines Tomić
Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1, 2015., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split
Ines Tomić (2015) 'Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1', diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split.
@phdthesis{phdthesis, year = {2015}, pages = {30+V}, keywords = {neribosomske peptid-sintetaze/ adenilacijska domena/ tirocidin-sintetaza 1/ strukturna dinamika}, title = {Utjecaj vezanja supstrata na fluorescencijska svojstva adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1}, keyword = {neribosomske peptid-sintetaze/ adenilacijska domena/ tirocidin-sintetaza 1/ strukturna dinamika}, publisherplace = {Split} }
@phdthesis{phdthesis, year = {2015}, pages = {30+V}, keywords = {nonribosomal peptide synthetases/ adenylation domain/ tyrocidine synthetase 1/ structural dynamics}, title = {The influence of substrate binding on fluorescence properties of the adenylation domain in tyrocidine synthetase 1}, keyword = {nonribosomal peptide synthetases/ adenylation domain/ tyrocidine synthetase 1/ structural dynamics}, publisherplace = {Split} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font