hrvatski

Dokazivanje i filogenetska analiza norovirusa izdvojenih iz školjkaša s proizvodnih područja u Republici Hrvatskoj

Norovirus je jedan od vodećih uzročnika epidemijskih i sporadičnih slučajeva gastroenteritisa u svijetu. Bioakumulira se u školjkašima koji su poznati kao prijenosnik humanih patogena, unatoč regulativi baziranoj na E. coli (<230 MPN).Svrha ovog istraživanja je procjena prisutnosti norovirusa u školjkašima podrijetlom s hrvatskih proizvodnih područja. Uzorci hepatopankreasa školjkaša su pretraženi real-time RT-PCR uz dodatak procesne kontrole (mengovirus). Ukupno je analizirano 443 uzorka s zadovoljavajućom efikasnošću ekstrakcije. Norovirus je utvrđen u 47 uzoraka obje genogrupe, s znatno većom reprezentacijom GII pozitivnih uzoraka (78%), nego GI (22%). Prevalencija norovirusa je 10, 61%. Norovirus je utvrđen na četiri proizvodna područja ; Ušće rijeke Krke, Kanal sv. Ante, Kaštelanski zaljev i Malostonski zaljev. Uočena je sezonska varijacija nivoa NoV s najvećim brojem pozitivnih uzoraka u prosincu, siječnju i veljači. Filogenetskom analizom nukleotidnog slijeda ORF2 odsječka utvrđena su dva genotipa NoV GII u uzorcima školjkaša GII.4 i GII.3. Analizirano je i sedam uzoraka stolice ljudi u kojima je utvrđen NoV GI i GII, a filogenetskom analizom ORF2 odsječka utvrđen je GII.2 i GII.4 koji je 100% identičan u usporedbi s izolatom Hu/GII.4/sydney/NSW05.

norovirus; školjkaši; filogenetska analiza; Hrvatska

nije evidentirano