hrvatski

Značaj komparativne genomike u otkrivanju novih seril-tRNA-sintetaza i srodnih enzima

Aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS) su neophodni enzimi za život svake stanice. Kataliziraju esterifikaciju transfer RNA pripadnim aminokiselinama, a nastale aminoacil-tRNA potom sudjeluju u biosintezi proteina na ribosomu. Zbog esencijalne uloge i prisustva u svim organizmima smatra se da su se aaRS pojavile među prvim enzimima pri nastanku života. Jedna aaRS je specifična za jednu aminokiselinu i jednu porodicu tRNA-izoakceptora s antikodonom za dotičnu aminokiselinu. Postoji velika sličnost među aaRS iz različitih organizama koje aktiviraju istu aminokislinu. Ipak, genomske i filogenetske analize ukazale su na postojanje osebujnih predstavnika ove, inače konzervirane skupine enzima. Primjer su seril-tRNA-sintetaze (SerRS) metanogenog tipa, koje su zastupljene samo u metanogenim arhejama. Kristalografski i biokemijski studiji potvrdili su njihovu atipičnu strukturu i drugačiji mehanizam djelovanja. Još neobičniji homolozi atipičnih SerRS otkriveni su u mnogim bakterijama na temelju genomske analize. Ti su enzimi krnji i nedostaje im čitava regija za vezanje tRNA. Umjesto tRNA aminoaciliraju male proteine (tzv. protein-nosače ; CP) koji imaju kovalentno vezanu fosfopanteteinsku prostetičku skupinu te djeluju kao aminokiselina:CP-ligaze. Analiza genomskih okolina za aa:CP-ligaze i pripadne protein-nosače (CP) pomaže u otkrivanju biokemijskih putova u kojima sudjeluju novootkriveni proteini.

aminoacil-tRNA-sintetaze; komparativna genomika; filogenetska analiza; homolozi aminoacil-tRNA-sintetaza; biosinteza proteina; neribosomska sinteza peptida; aminokiselina:(protein-nosač)-ligaza; protein-nosač

nije evidentirano