hrvatski

Molekularna karakterizacija HIV-1 ovojnog glikoproteina izoliranog tijekom simptomatske primoinfekcije

U razdoblju od rujna 1996. do srpnja 1997. godine prikupljeni su uzorci krvi osmero bolesnika s HIV-1 simptomatskom primoinfekcijom u bolnici Croix-Rousse u Lyonu. Bolest je ustanovljena temeljem kliničke slike, epidemiološke anamneze i pozitivnih laboratorijskih testova (p24 antigen i broj kopija RNK/ml seruma). U istraživačkom laboratoriju Ecole Normale Superieure CNRS/bioMerieux iz njihove krvi ekstrahirana je DNK. Iz uzoraka je PCR metodom, korištenjem specifičnih oligonukleotida umnožena env regija HIV-1 genoma, klonirana i sekvencionirana (373 DNK sekvencor). Izvršena je molekularna karakterizacija env gena provirusne DNK integrirane u genom stanice u trenutku primoinfekcije, prije pojave imunološkog odgovora domaćina. U kohorti od osam bolesnika ustanovljeno je da izolati pripadaju glavnoj skupini M HIV-1. Sedmero bolesnika zaraženo je podtipom B HIV-1, od toga šestero u Francuskoj, a jedan u Alžiru, a jedan, zaražen u Kamerunu, podtipom A. Prikazane su osobitosti aminokiselinske sekvence ovojnog glikoproteina svakog od njih. Svrstani su u sojeve NSI fenotipa jer na značajnim pozicijama ne prevladavaju polarne aminokiseline. Sekvence su uspoređene s referalnim sojevima dobivenim iz banaka sojeva konstrukcijom filogenetskog stabla uz pomoć računalnih programa PHYLIP i ANTHEPROT. Potkrijepljena je činjenica velike genetske varijabilnosti virusa analizom pojedinih regija gp 120 i gp 41, gdje V3 pokazuje i neke atipične motive na vrhu petlje koji je najizloženiji humoralnom i celularnom imunološkom odgovoru. Izražena potreba nastavka ovakvog istraživanja u cilju poboljšanja dijagnostičkih testova koji će sadržavati antigene determinante “naivnih” virusa još neizmijenjenih pod utjecajem imunološkog odgovora i zato najantigeničnijih i najosjetljivijih za detekciju ranog humoralnog imunološkog odgovora te epidemiološkog nadzora nad rasprostranjenošću HIV-1 podtipova.

HIV-1; sekvenciranje; primoinfekcija

nije evidentirano