engleski

Analysis of mathematical model of ergosterol biosynthesis

U ovom radu provedena je analiza matematičkog modela biosinteze ergosterola (Alvarez-Vasquez i sur., 2011) korištenjem programskih paketa WR Mathematica 8.0. i CellDesigner 4.3. Analizirani model uključuje reakcije biosinteze ergosterola i sfingolipida, budući da je mnogobrojnim istraživanjima potvrđen sinergijski učinak spomenutih puteva biosinteze. Model uključuje 40 40 bilanci tvari danih u obliku diferencijalnih jednadžbi koje opisuju promjene koncentracija metabolita kao razliku brzina reakcija u kojima metaboliti nastaju i brzina reakcija u kojima se troše. Povedena je analiza stehiometrijske matrice modela, te su primjenom metoda lokalne i globalne osjetljivosti parametra, identificirani su ključni enzimi matematičkog modela. Rezultati lokalne analize uključuju transport ergosterola u staničnu membranu, uz hidrolize IPC-g i MIPC-g od strane enzima IPCaze, kao najosjetljivije reakcije modela. Kao ključni enzimi prilikom uspostavljanja ustaljenih vrijednosti, ističu se KDHS reduktaza, 4-hidroksilaza i ceramid sintaza.

egosterol biosynthesis model; local sensitivity analysis; global sensitivity; analysis

nije evidentirano