Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga (CROSBI ID 385058)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Ogrizek-Tomaš, Mario
Šikić, Mile
hrvatski
Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga
Usporednom analizom pretpostavljeno sličnih proteinskih sekvenci, javno dostupnih na online bazama podatkaa poput Ensembl-a možemo uočiti mrnoge probleme u kvaliteti sekvenciranja i obilježavanja genoma. Pokazujemo da korištenjem egzaktnih metoda poravnanja postoji mogućnost poboljšanja kvalitete obilježenih gena, te upotpunjenje sekvenci proteina kralježnjaka. Pretpostavku o sličnosti proteinskih sekvenci temeljimo na utvrđenoj ontologiji među promatranim proteinima u različitim vrstama. Razvijeni sustav pronalazi eksone koji nedostaju u krajnjem proteinskom produktu, te generira nove i upotpunjene proteinske sekvence. Razvijena je web aplikacija koja nudi rezultate dobivene sustavom za automatsku analizu protein kodirajućih gena javno na Internetu.
paralozi; eksoni; poravnanje; web
nije evidentirano
engleski
Web application for comparative analysis of protein paralogs
nije evidentirano
paralogs; exon; alignment; web
nije evidentirano
Podaci o izdanju
59
07.07.2012.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb