Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 687205

Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga


Ogrizek-Tomaš, Mario
Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga 2012., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


Naslov
Web aplikacija za usporednu analizu proteinskih paraloga
(Web application for comparative analysis of protein paralogs)

Autori
Ogrizek-Tomaš, Mario

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
07.07

Godina
2012

Stranica
59

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
Paralozi; eksoni; poravnanje; web
(Paralogs; exon; alignment; web)

Sažetak
Usporednom analizom pretpostavljeno sličnih proteinskih sekvenci, javno dostupnih na online bazama podatkaa poput Ensembl-a možemo uočiti mrnoge probleme u kvaliteti sekvenciranja i obilježavanja genoma. Pokazujemo da korištenjem egzaktnih metoda poravnanja postoji mogućnost poboljšanja kvalitete obilježenih gena, te upotpunjenje sekvenci proteina kralježnjaka. Pretpostavku o sličnosti proteinskih sekvenci temeljimo na utvrđenoj ontologiji među promatranim proteinima u različitim vrstama. Razvijeni sustav pronalazi eksone koji nedostaju u krajnjem proteinskom produktu, te generira nove i upotpunjene proteinske sekvence. Razvijena je web aplikacija koja nudi rezultate dobivene sustavom za automatsku analizu protein kodirajućih gena javno na Internetu.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Branko Jeren, )

Ustanove
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb