hrvatski

Analiza gena za proteine SSB u genomima bakterija roda 'Candidatus Phytoplasma'

Fitoplazme ('Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez stanične stijenke koje koloniziraju biljke i neke skupine kukaca. Genom fitoplazmi sadrži mnogo ponavljajućih jedinica te ponekad i izvankromosomske elemente na kojima se mogu nalaziti geni prisutni u više kopija u genomu. Jedan od tih gena je i gen za proteine SSB. Proteini SSB imaju esencijalnu ulogu u preživljavanju stanice i nalaze se u svim domenama živog svijeta, ali i virusa. Geni za proteine SSB prisutni su u različitom broju u genomima fitoplazmi, no postoji samo jedna kopija koja ima drugačije evolucijsko porijeklo od ostalih te se smatra izvornom kopijom gena ssb. Izvorna kopija gena ssb većeg broja fitoplazmatskih izolata vrsta 'Ca. P asteris' i 'Ca. P. solani' s područja Hrvatske umnožena je metodom PCR i sekvencirana. Filogenetskom analizom pokazana je očuvanost izvorne kopije gena ssb. Nadalje, potvrđeno je da postoji jedna kopija tog gena u genomu izolata fitoplazmi vrste 'Ca. P. asteris', dok je kod biljnog uzorka vrste 'Ca. P. solani' dokazana još jedna kopija tog gena, koja se ne pojavljuje kod uzorka fitoplazmi izoliranog iz kukca.

fitoplazme; gen ssb; izvorna kopija; filogenetska analiza; Southern blot

nije evidentirano