engleski

Diversity of genes encoding molecular chaperonin GroEL in the genomes of bacteria from the genus ‘Candidatus Phytoplasma’

Fitoplazme ('Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez stanične stijenke iz razreda Mollicutes. Obligatni su simbionti biljaka i kukaca te uzrokuju brojne ekonomski značajne bolesti mnogih poljoprivrednih kultura u cijelome svijetu. Nemoguće ih je uzgajati u mediju bez stanica, čime je njihova detekcija i klasifikacija otežana. Molekularni šaperonin GroEL pomaže u smatanju drugih proteina, a prisustvo ovog gena detektirano je u svim potpuno sekvenciranim genomima fitoplazmi. Zbog mnogobrojnih uloga proteina GroEL, ovaj je gen istražen u novim izolatima fitoplazmi ribosomske podskupine 16SrXII-A, koje pripadaju vrsti 'Ca. P. solani' i uzrokuju ekonomski značajne štete vinove loze (Vitis vinifera L.). Gen za molekularni šaperonin GroEL iz nekoliko izolata uspješno je umnožen PCR-om, nakon čega je određen slijed nukleotida ovog gena, a metodom Southern blot detektirana je jedna kopija gena u genomu. Raznolikost gena novih izolata i gena iz poznatih genoma ispitana je filogenetskim analizama, koje su pokazale očekivano grupiranje fitoplazmi s obzirom na 16Sr skupine, što ovaj gen čini pogodnim markerom za analizu evolucijskih odnosa među fitoplazmatskim vrstama kao i varijabilnost izolata unutar pojedine vrste.

Candidatus Phytoplasma solani; phytoplasma; stolbur group; Southern blot; phylogenetic analysis; molecular marker

nije evidentirano