Razvoj metoda za analizu DNA mikrosatelita i njihova primjena za identifikaciju goveda (CROSBI ID 383399)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Petar Projić
Primorac, Dragan
hrvatski
Razvoj metoda za analizu DNA mikrosatelita i njihova primjena za identifikaciju goveda
Za analizu humane DNA koriste se tetranukleotidni STR sustavi, dok se za analizu uzoraka animalnog podrijetla najčešće koriste dinukleotidni mikrosateliti. Međunarodno društvo za animalnu genetiku (ISAG), za ispitivanje podrijetla goveda, preporučilo je 30 najčešćih dinukleotida prisutnih u različitim kombinacijama u postojećim komercijalnim kitovima. Korištenjem jednog od alata (Tandem-Repeats Finder) „in silico mining“ pretraživanjem mikrosatelitnih sljedova iz baze podataka DNA sljedova (UniGene NCBI) za goveda, odabrani su novi, visoko polimorfni mikrosateliti (tetranukleotidi), do sada neprimijenjeni u postupcima utvrđivanja identiteta kod goveda. Testirani su na uzorku od 110 goveda i uspoređeni s mikrosatelitima uključenim u komercijalni set reagensa tvrtke Applied Biosystems. Ispitan je i velik broj postojećih, preporučenih mikrosatelita. Odabrana je statistički najznačajnija kombinacija - novorazvijeni multiplex STR sustav (12 STR lokusa), u sklopu kojeg je razvijena i integrirana alelna ljestvica. Dobiveni rezultati omogućiti će primjenu biljega čija će uporaba povećati vrijednost i preciznost budućih DNA analiza kod goveda, te ih približiti vrijednostima analiza DNA humanog podrijetla.
in silico mining; govedo (Bos Taurus); mikrosateliti; novi biljezi; populacijska studija
nije evidentirano
engleski
The development of methods for DNA microsatellites analysis and their applicationfor bovine identification
nije evidentirano
in silico mining; cattle (Bos Taurus); microsatellite; new markers; population studies
nije evidentirano
Podaci o izdanju
116
17.12.2013.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb