hrvatski

Analiza polimorfizma transkripcijskih faktora vinove loze CBF1 i CBF4 povezanih s reakcijom na abiotski stres suše

Kultivirana vinova loza (Vitis vinifera subsp. sativa) gospodarski je najznačajnija višegodišnja voćna kultura, domesticirana je iz populacije divlje loze (Vitis vinifera subsp. sylvestris). Temelj vinogradarske proizvodnje predstavljaju sorte kultivirane loze, koje uvelike variraju u različitim gospodarskim i biološkim svojstvima, uključujući otpornost na abiotski stres. Vinova loza relativno dobro podnosi sušu, no nedostatak vode može biti ograničavajući čimbenik njenog uzgoja, naročito u kontekstu predviđenih klimatskih promjena. Kod vinove loze detektirano je više od 2000 gena čiji se broj transkripata mijenja uslijed vodnog stresa. U tu skupinu spadaju i CBF1 i CBF4 transkripcijski faktori, uključeni u ovo istraživanje kao geni kandidati zbog pretpostavljnog utjecaja na razinu otpornosti na sušu. Uz specifične početnice, navedeni geni su umnoženi PCR-om u setu od 96 uzoraka vinove loze, sačinjenom od predstavnika divlje i sorata kultivirane loze. Tri ispitivane skupine sorata kultivirane loze odabrane su na temeljnu njihove razine otpornosti na sušu. U sekvenciranim fragmentima CBF4 gena detektirano je 24 SNP-a i četiri INDEL-a. Provedena je usporedba parametara diverziteta između dviju podvrsta loze, kao i dviju skupina sorata kultivirane s najvećom razlikom u otpornosti na sušu. Opažen je visok nukleotidni diverzitet (π = 0.00856 ; θ = 0.00474), manji kod divlje loze u odnosu na kultiviranu. Tajima testom neutralnosti utvrđeno je da mutacije odstupaju od neutralnog modela kod divlje loze i u skupini sorata s najvećom otpornošću na sušu. Rezultati sugeriraju da su se određene mutacije u transkripcijskom faktoru CBF4 pojavile tijekom domestikacije i evolucije iz divlje forme u kultiviranu, a unutar sorata s najvećom otpornošću na sušu potvrđena je svojevrsna selekcija. Preporučuju se daljnja istraživanja polimorfizma gena reguliranih transkripcijskim faktorom CBF4 uslijed abiotskog stresa kod sorata s različitom otpornošću na sušu.

Vitis vinifera; CBF4; abiotski stres; suša; SNP

voditelj: Ivan Pejić