Predviđanje kodirajućih regija u genomu metodama digitalne obrade signala (CROSBI ID 381031)
Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad
Podaci o odgovornosti
Baličević, Vedrana
Seršić, Damir
hrvatski
Predviđanje kodirajućih regija u genomu metodama digitalne obrade signala
Činjenica da se proteini kodiraju iz aminokiselina formiranih prema kombinaciji tri uzastopna nukleotida, upućuju na mogućnost da kodirajući dijelovi gena pokazuju svojstvo periodičnosti s periodom 3. Kodirajuće eksone pokušano je na temelju ovog svojstva detektirati filtrima temeljenim na svepropusnom filtru, što je provjereno izračunom DFT. Istraživanje je pokazalo da je manji udio eksona uspješno detektiran i za njih je preciznost detektora vrlo visoka, dok je znatno veći dio eksona ostao nedetektiran. Zaključak je da svojstvo periodičnosti s 3 ne može biti samostalan kriterij detekcije eksona, ali ako postoje značajke (koje je tek potrebno otkriti) koje vrijede za druge eksone, tada bi u kombinaciji s njihovim detektorima bilo moguće istovremeno predvidjeti eksone različitih svojstava.
gen; genom; ekson; intron; period; detektor; nukleotid; kodirajući; nekodirajući; mjesto izrezivanja; filtar; DFT
nije evidentirano
engleski
Detection of protein-coding regions in genome using digital signal processing methods
nije evidentirano
gene; genome. exon; intron; period; detector; nucleotide; coding; non-coding; splice-site; filter; DFT
nije evidentirano
Podaci o izdanju
40
17.07.2009.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb