Dokazivanje i filogenetska analiza astrovirusa izdvojenih iz potencijalnih životinjskih rezervoara u Republici Hrvatskoj (CROSBI ID 379185)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Brnić, Dragan
Jemeršić, Lorena ; Starešina, Vilim
hrvatski
Dokazivanje i filogenetska analiza astrovirusa izdvojenih iz potencijalnih životinjskih rezervoara u Republici Hrvatskoj
Astrovirusi su široko rasprostranjeni emergentni RNA virusi dokazani u brojnih vrsti sisavaca i ptica. Rezultati prikazani ovom disertacijom donose nove spoznaje o prisutnosti astrovirusa u potencijalnih životinjskih rezervoara u Republici Hrvatskoj. Uzorci su pretraženi molekularnim metodama detekcije odsječka polimeraznog gena različitih vrsti astrovirusa i kapsidnog gena svinjskog astrovirusa, uz primjenu postupka izolacije astrovirusa na kulturi stanica. Rezultati pokazuju da je astrovirus visoko prevalentan u populaciji domaćih svinja (90, 2%), a dokazan je u svih dobnih kategorija neovisno o tipu uzgoja. Nalaz u serumu (3, 9%) i slezeni (11, 6%) je i prvi ekstraintestinalni dokaz svinjskog astrovirusa, što upućuje na složeniju patogenezu. Filogenetska analiza govori o iznimno velikoj genetskoj raznolikosti astrovirusa domaćih svinja, jer su dokazani svi do sada opisani genotipovi, ali i potencijalno novi podgenotipovi. Prisutnost genotipova PoAstV-3 i PoAstV-5 je opisana prvi puta izvan Sjeverne Amerike. Za istaknuti je i pojava miješanih infekcija s različitim genotipovima i/ili rekombinacije između istih. Izmjenom metode izolacije na kulturi stanica, uspješno je umnožen svinjski astrovirus. Divlje svinje su također domaćini astrovirusima, ali zamjetno rjeđe (28, 6%) u usporedbi s domaćim svinjama. Prijenos astrovirusa s domaćih na divlje svinje je vrlo vjerojatan obzirom da izolati pripadaju istim genotipovima svinjskog astrovirusa, iako su opisane i potencijalno nove vrste specifične za divlje svinje. Osim dokaza svinjskih astrovirusa genotipa PoAstV-1 i PoAstV-3, blisko filogenetski povezanih s astrovirusima čovjeka, mogući javno-zdravstveni problem istaknut je i dokazom astrovirusa u probavnim žlijezdama školjkaša (8, 3%), koji ukazuju na fekalno zagađenje humanog i animalnog porijekla.
astrovirus; domaće svinje; divlje svinje; školjkaši; genetska raznolikost; Hrvatska
nije evidentirano
engleski
Detection and phylogenetic analysis of astroviruses isolated from potential animal reservoirs in Croatia
nije evidentirano
astrovirus; domestic pigs; wild boars; bivalves; genetic diversity; Croatia
nije evidentirano
Podaci o izdanju
140
29.05.2013.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Veterinarski fakultet, Zagreb
Zagreb