hrvatski

Novi inhibitori metalopeptidaza porodice M49

Dipeptidil-peptidaza III (DPP III), metalopeptidaza iz porodice M49, je enzim s ulogom u unutarstaničnom katabolizmu proteina i obrani od oksidativnog stresa. Kristalografski određene strukture ljudske i kvaščeve DPP III slične su i otkrivaju dvo-domenski protein. S ciljem pronalaženja novih nepeptidnih inhibitora ljudske DPP III, taj enzim je pročišćen iz eritrocita i istražen je utjecaj niza ciklobutanskih derivata supstituiranih benzimidazola na njegovu aktivnost. Za derivat benzimidazola s izrazitim inhibitornim djelovanjem (IC50 ≈ 3 μmol L-1) te za supstrat arginil-arginil-7-amido-4-metil kumarin (Km = 13, 5 μmol L-1, kcat = 3, 9 s-1), korištenjem metoda molekulskog modeliranja sagrađeni su nekovalentni kompleksi s ljudskom DPP III i ispitan je utjecaj ovih liganada na strukturu i fleksibilnost enzima. Istim pristupom utvrđene su i interakcije kvaščeve DPP III s tim derivatom benzimidazola te s hidroksamatnim inhibitorom Tyr-Phe-NHOH. Rezultati otkrivaju da su ciklobutanski derivati benzimidazola novi inhibitori metalopeptidaza porodice M49 te omogućuju uvid u interakcije bitne za vezanje liganda u njihovo aktivno mjesto.

metalopeptidaze; porodica M49; dipeptidil-peptidaza III; derivati benzimidazola; molekulsko modeliranje

nije evidentirano