hrvatski

FPGA implementacija Smith-Waterman algoritma

Predložena je sklopovska implementacija Smith-Waterman algoritma. Model sklopovlja razvijen je u jeziku VHDL, te je optimiran za implementaciju na programabilnim logičkim poljima (FPGA) familije Virtex-6 proizvođača Xilinx, Inc. Posebna pažnja posvećena je brzini rada. Uhodano je sučelje za komunikaciju FPGA razvojnog sustava s osobnim računalom preko PCI sabirnice te je integrirano sučelje sa sklopovljem Smith-Waterman algoritma. Razvijeno je odgovarajuće ispitno okruženje, provedena simulacija, te je sustav ispitan u radu sa stvarnim podacima.

programabilna logička polja; FPGA; Smith-Waterman

nije evidentirano