Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 637135

Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja


Pavlović, Dario
Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


CROSBI ID: 637135 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja
(Evaluation of a method for long read error correction)

Autori
Pavlović, Dario

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
01.07

Godina
2013

Stranica
20

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
De novo; sastavljanje genoma; preklapanje; sw#
(De novo; genome assembly; overlap; sw#)

Sažetak
Sastavljanje genoma jedan je od temeljnih problema bioinformatike. Njegova važnost za razumijevanje brojnih pojava u živom svijetu je neporeciva. Proces sastavljanja genoma je vrlo težak i računalno zahtjevan proces koji uključuje više koraka. Postoji nekoliko metoda izvođenja rekonstrukcije genoma od kojih svaka nudi neke prednosti, ali i nailazi na probleme i izazove. De novo pristup izvodi se na više načina od kojih je najznačajni Preklapanje-Izravnavanje-Konsenzus. Prva faza ili preklapanje za cilj ima pronaći najbolja preklapanja između očitanja genoma i izgraditi graf povezanosti tih očitanja. U grafu, čvorovi predstavljaju očitanja, a bridovi preklapanja. Na taj način gradi se usmjeren netežinski graf. Faza preklapanja osjetljiva je na pogreške u očitanjima, a cilj je ovoga rada ispitati kako različiti postotci pogrešaka utječu na sposobnost detekcije točnih preklapanja.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo



POVEZANOST RADA


Projekti:
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Jeren, Branko, MZOS ) ( POIROT)

Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Profili:

Avatar Url Mile Šikić (mentor)

Citiraj ovu publikaciju

Pavlović, Dario
Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja, 2013., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
Pavlović, D. (2013) 'Evaluacija metode za ispravljanje pogrešaka kod dugačkih očitanja', diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Pavlovi\'{c}, D.}, year = {2013}, pages = {20}, keywords = {De novo, sastavljanje genoma, preklapanje, sw\#}, title = {Evaluacija metode za ispravljanje pogre\v{s}aka kod duga\v{c}kih o\v{c}itanja}, keyword = {De novo, sastavljanje genoma, preklapanje, sw\#}, publisherplace = {Zagreb} }
@phdthesis{phdthesis, author = {Pavlovi\'{c}, D.}, year = {2013}, pages = {20}, keywords = {De novo, genome assembly, overlap, sw\#}, title = {Evaluation of a method for long read error correction}, keyword = {De novo, genome assembly, overlap, sw\#}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font