Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija (CROSBI ID 378689)

Ocjenski rad | diplomski rad

Kušević, Katarina Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija / Šikić, Mile (mentor); Zagreb, Fakultet elektrotehnike i računarstva, . 2013

Podaci o odgovornosti

Kušević, Katarina

Šikić, Mile

hrvatski

Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija

Algoritam implementiran ovim radom računa elektrostatsku silu i energiju solvatacije proteina. Elektrostatska sila računa se kao zbroj elektrostatskih sila pri međusobnim interakcijama svih atoma u svim aminokiselinama. Podaci potrebni za računanje dobivaju se učitavanjem PDB datoteka i učitavanjem naboja svakog atoma u određenoj aminokiselini. Energija solvatacije računa se kao zbroj energija solvatacije svih aminokiselina u proteinu.Za izračun energije solvatacije potrebni podaci učitavaju se iz datoteke s vrijednostima površina dostupnih otapalu i potencijalom otapala te iz datoteke s radijusom atoma svake aminokiseline. Dobivene vrijednosti se koreliraju s koeficijentom privlačnosti proteina.

Proteini; Elektrostatska sila; Energija solvatacije; Koeficijent privlačnosti; ASA; Aminokiseline; JAVA; Korelacija

nije evidentirano

engleski

Computing method for determing protein interactions

nije evidentirano

Proteins; Electrostatic energy; Solvation energy; Affinity data; ASA; Amino acids; JAVA; Corelation

nije evidentirano

Podaci o izdanju

53

09.07.2013.

obranjeno

Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj

Fakultet elektrotehnike i računarstva

Zagreb

Povezanost rada

Računarstvo, Biologija