Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 636714

Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija


Kušević, Katarina
Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


CROSBI ID: 636714 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija
(Computing method for determing protein interactions)

Autori
Kušević, Katarina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
09.07

Godina
2013

Stranica
53

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
Proteini; Elektrostatska sila; Energija solvatacije; Koeficijent privlačnosti; ASA; Aminokiseline; JAVA; Korelacija
(Proteins; Electrostatic energy; Solvation energy; Affinity data; ASA; Amino acids; JAVA; Corelation)

Sažetak
Algoritam implementiran ovim radom računa elektrostatsku silu i energiju solvatacije proteina. Elektrostatska sila računa se kao zbroj elektrostatskih sila pri međusobnim interakcijama svih atoma u svim aminokiselinama. Podaci potrebni za računanje dobivaju se učitavanjem PDB datoteka i učitavanjem naboja svakog atoma u određenoj aminokiselini. Energija solvatacije računa se kao zbroj energija solvatacije svih aminokiselina u proteinu.Za izračun energije solvatacije potrebni podaci učitavaju se iz datoteke s vrijednostima površina dostupnih otapalu i potencijalom otapala te iz datoteke s radijusom atoma svake aminokiseline. Dobivene vrijednosti se koreliraju s koeficijentom privlačnosti proteina.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Računarstvo



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Branko Jeren, )
098-1191344-2860 - Proučavanje biomakromolekula računalnim metodama i razvoj novih algoritama (Sanja Tomić, )

Ustanove
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Profili:

Avatar Url Mile Šikić (mentor)

Citiraj ovu publikaciju

Kušević, Katarina
Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija, 2013., diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
Kušević, K. (2013) 'Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija', diplomski rad, diplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Ku\v{s}evi\'{c}, K.}, year = {2013}, pages = {53}, keywords = {Proteins, Electrostatic energy, Solvation energy, Affinity data, ASA, Amino acids, JAVA, Corelation}, title = {Computing method for determing protein interactions}, keyword = {Proteins, Electrostatic energy, Solvation energy, Affinity data, ASA, Amino acids, JAVA, Corelation}, publisherplace = {Zagreb} }