Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija (CROSBI ID 378689)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Kušević, Katarina
Šikić, Mile
hrvatski
Računalna metoda za računanje proteinskih interakcija
Algoritam implementiran ovim radom računa elektrostatsku silu i energiju solvatacije proteina. Elektrostatska sila računa se kao zbroj elektrostatskih sila pri međusobnim interakcijama svih atoma u svim aminokiselinama. Podaci potrebni za računanje dobivaju se učitavanjem PDB datoteka i učitavanjem naboja svakog atoma u određenoj aminokiselini. Energija solvatacije računa se kao zbroj energija solvatacije svih aminokiselina u proteinu.Za izračun energije solvatacije potrebni podaci učitavaju se iz datoteke s vrijednostima površina dostupnih otapalu i potencijalom otapala te iz datoteke s radijusom atoma svake aminokiseline. Dobivene vrijednosti se koreliraju s koeficijentom privlačnosti proteina.
Proteini; Elektrostatska sila; Energija solvatacije; Koeficijent privlačnosti; ASA; Aminokiseline; JAVA; Korelacija
nije evidentirano
engleski
Computing method for determing protein interactions
nije evidentirano
Proteins; Electrostatic energy; Solvation energy; Affinity data; ASA; Amino acids; JAVA; Corelation
nije evidentirano
Podaci o izdanju
53
09.07.2013.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb