hrvatski

Istraživanje interakcija malih molekula s polinukleotidima spektroskopijom površinski pojačanog Ramanovog raspršenja

Spektroskopija površinski pojačanog Ramanovog raspršenja (SERS) primijenjena je pri istraživanju interakcija malih organskih molekula sa svojstvima interkaliranja (ADAP) i vezanja u utore (IM, PY, Sp, PHENPOD, PYPOD) s jednolančanim RNA polinukleotidima te dvolančanim DNA i RNA polinukleotidima. Kao metalni supstrati korištene su koloidne suspenzije srebra pripravljene redukcijom srebrova nitrata. Istraživane male molekule intenzivno raspršuju zračenje kada se nalaze blizu ili su vezane na nanočestice srebra. Ovisno o koncentraciji različito se orijentiraju na površini metala, pri čemu smanjenje koncentracije do 5*10-6 mol dm-3 prati pojačanje raspršenog zračenja spojeva ADAP, PHENPOD i PYPOD, za razliku od slabljenja raspršenja spojeva IM i PY te Sp. Nove vrpce u spektrima smjesa malih molekula s polinukleotidima pripisane su vibracijama dijelova polinukleotida koji sudjeluju u interakcijama. SERS spektri smjesa poliaminskih spojeva i jednolančanih RNA polinukleotida ukazuju na interakcije malih molekula s dušičnim bazama polinukleotida poli A, poli G, poli C i poli U. Male molekule spojeva IM i PY vežu se u mali i veliki utor dvostruke uzvojnice polinukleotida poli dAdT–poli dAdT, dok interakcije s dušičnim bazama stvaraju samo u velikom utoru polinukleotida poli dGdC–poli dGdC, poli rA–poli rU te ct-DNA. Molekule spoja Sp, koje strukturno odgovaraju aminometilenskim poveznicama u molekulama IM i PY, vežu se na isti način s DNA/RNA polinukleotidima kao i poliaminske molekule. Molekule složenije strukture, PHENPOD i PYPOD, također se vežu u oba utora dvolančanog polinukleotida adenina i timina. Analizom SERS spektara nisu opažene interakcije s polinukleotidom gvanina i citozina, dok se slabim interakcijama u veliki utor dvolančanog RNA polinukleotida veže samo PHENPOD. Također je utvrđeno da molekule PHENPOD fenantrolinskim sustavom interkaliraju u dvostruku uzvojnicu nekih DNA analoga. Smanjenje intenziteta raspršenog zračenja u spektru kompleksa ADAP/ct-DNA ukazuje na interkaliranje spoja u uzvojnicu nukleinske kiseline.

površinski pojačano Ramanovo raspršenje ; DNA/RNA polinukleotidi ; koloid srebra

nije evidentirano