Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 626054

Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima


Ivić, Nives
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima, 2013., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


CROSBI ID: 626054 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima
(Structural characterization of bacterial glycine: [carrier protein] ligase and its complexes with substrates)

Autori
Ivić, Nives

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.04

Godina
2013

Stranica
88

Mentor
Luić, Marija

Ključne riječi
biomakromolekulska kristalografija ; aminokiselina:[protein-nosač]-ligaza ; homolog seril-tRNA-sintetaze ; protein-nosač ; Bradyrhizobium japonicum
(biomacromolecular crystallography ; amino acid:[carrier protein] ligase ; seryl-tRNA sinthetase homolog ; carrier protein ; Bradyrhizobium japonicum)

Sažetak
Nedavno je otkrivena nova porodica enzima sličnih metanogenom tipu seril-tRNA-sintetaza. Nazvani aminokiselina:[protein-nosač]-ligaze, ovi homolozi umjesto serina tioesterski vežu glicin ili alanin na odgovarajući protein-nosač (CP) umjesto na tRNA. U ovom radu je strukturno okarakteriziran član te porodice ; glicin:[protein-nosač]-ligaza 1 (Bj Gly:CP-ligaza 1) iz bakterije Bradyrhizobium japonicum. Usporedba kristalnih struktura Bj Gly:CP-ligaze 1 i metanogenog tipa seril-tRNA- sintetaze je otkrila strukturnu očuvanost katalitičke domene i aktivnog mjesta enzima. Strukture Bj Gly:CP-ligaze 1 u kompleksu s malim supstratima (ATP-om i analogom glicil-adenilata) su ukazale na potencijalne aminokiseline odgovorne za diskriminaciju glicina i očuvanost mehanizma aktivacije glicina. Analiza strukture kompleksa Bj Gly:CP-ligaze 1 i odgovarajućeg CP-a je otkrila međudjelovanje proteina isključivo preko CP-vezne zavojnice karakteristične za aminokiselina: [protein-nosač]-ligaze. Dizajnirana je hibridna Gly:CP-ligaza u kojoj je CP-vezna zavojnica iz Bj Gly:CP-ligaze 1 zamijenjena odgovarajućom iz Agrobacterium tumefaciens alanin:[protein-nosač]- ligaze. Usporedbom kompleksa ligaza s odgovarajućim CP-om razjašnjena je strukturna osnova na temelju koje aa:CP-ligaze razlikuju protein-nosače.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija



POVEZANOST RADA


Projekti:
MZOS-098-1191344-2943 - Protein-ligand međudjelovanja na atomnoj razini (Luić, Marija, MZOS ) ( POIROT)

Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Profili:

Avatar Url Marija Luić (mentor)

Avatar Url Nives Ivić (autor)

Poveznice na cjeloviti tekst rada:

Pristup cjelovitom tekstu rada

Citiraj ovu publikaciju:

Ivić, Nives
Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima, 2013., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Ivić, N. (2013) 'Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosač]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima', doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Ivi\'{c}, N.}, year = {2013}, pages = {88}, keywords = {biomakromolekulska kristalografija, aminokiselina:[protein-nosa\v{c}]-ligaza, homolog seril-tRNA-sintetaze, protein-nosa\v{c}, Bradyrhizobium japonicum}, title = {Strukturna karakterizacija bakterijske glicin: [protein-nosa\v{c}]-ligaze i njenih kompleksa sa supstratima}, keyword = {biomakromolekulska kristalografija, aminokiselina:[protein-nosa\v{c}]-ligaza, homolog seril-tRNA-sintetaze, protein-nosa\v{c}, Bradyrhizobium japonicum}, publisherplace = {Zagreb} }
@phdthesis{phdthesis, author = {Ivi\'{c}, N.}, year = {2013}, pages = {88}, keywords = {biomacromolecular crystallography, amino acid:[carrier protein] ligase, seryl-tRNA sinthetase homolog, carrier protein, Bradyrhizobium japonicum}, title = {Structural characterization of bacterial glycine: [carrier protein] ligase and its complexes with substrates}, keyword = {biomacromolecular crystallography, amino acid:[carrier protein] ligase, seryl-tRNA sinthetase homolog, carrier protein, Bradyrhizobium japonicum}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font