Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 616362

SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA MANOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA


Štivojević, Marija
SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA MANOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA 2012., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


Naslov
SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA MANOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA
(SYNTHESIS AND CONFORMATIONAL ANALYSIS OF MANNOSYLATED ADAMANTYLTETRAPEPTIDE)

Autori
Štivojević, Marija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.12

Godina
2012

Stranica
85

Mentor
Tomić-Pisarović, Srđanka ; Mihalić, Zlatko

Neposredni voditelj
Ribić, Rosana ; Kodrin, Ivan

Ključne riječi
Muramildipeptid; (adamant-1-il)tripeptid; L-serin; D-manoza; sinteza peptida; vodikove veze; konformacijska analiza; populacijska analiza
(Muramyldipeptide; (adamant-1-yl)tripeptide; D-mannose; L-serine; peptide synthesis; hydrogen bonds; conformational analysis; population analysis)

Sažetak
Muramildipeptid (MDP), N-acetilmuramil-L- alanil-D-izoglutamin (L-Ala-D-isoGln), najmanja je strukturna jedinica peptidoglikana koja pokazuje imunostimulatornu (adjuvantsku) aktivnost. Adamantildesmuramildipeptidi koji na L-Ala-D-isoGln imaju vezanu lipofilnu adamantansku podjedinicu, AdGly-L-Ala-D-isoGln, apirogeni su i netoksični spojevi koji pokazuju imunostimulatorno djelovanje u pokusima in vivo. U ovom radu opisana je sinteza i konformacijska analiza novog manoziliranog adamantiltetrapeptida, O-α-D-manopiranozil-L- seril-D, L-(adamant-1-il)glicil-L-alanil-D- izoglutamina. Prvo je pripravljen racemični Boc-(adamant-1-il)glicin koji je zatim kondenziran s benzilnim esterom L-Ala-D-isoGln. N-(Fmoc)-O-(2, 3, 4, 6-tetra-O-acetil-α-D- manopiranozil)-L-serin pripravljen je direktnom metodom glikozilacije, kondenzacijom peracetilirane D-manoze i N-(Fmoc)-L-serina. Konačni produkt, O-α-D-manopiranozil-L-seril-D, L-(adamant-1-il)glicil-L-alanil-D-izoglutamin, pripravljen je u tri sintetska koraka. Prvi korak u sintezi bila je kondenzacija N-(Fmoc)- O-(2, 3, 4, 6-tetra-O-acetil-α-D- manopiranozil)-L-serina i deprotektiranog adamantiltripeptida, a zatim su u dva stupnja uklonjene zaštitne skupine (N-Fmoc, acetilni i benzilni ester). U sintezi peptida korištena je karbodiimidna metoda stvaranja peptidne veze uz 1-etil-3-(3'-dimetilaminopropil)karbodiimid hidroklorid (EDC•HCl) kao kondenzacijski reagens i 1-hidroksi-benzotriazol (HOBt) kao pomoćni reagens. Za promjenu biološke (adjuvantske) aktivnosti molekula mogu biti odgovorne promjene u primarnoj strukturi peptida, kao i konformacijske promjene koje utječu na njihovo strukturiranje. Slabe interakcije u peptidima imaju važnu ulogu kod nastajanja sekundarnih struktura poput - zavojnica, -nabranih ploča i okreta. Konformacijskom analizom pronađene su energijski najpovoljnije strukture desmuramildipeptida, (adamant-1-il)tripeptida, L-Ser-L-AdGly-L-Ala-D-isoGln tetrapeptida i manoziliranog adamantiltetrapeptida. Korištena je kombinacija sustavnog pretraživanja konformacijskog prostora molekulskom mehanikom (OPLS_2005 i AMBER* poljima sila), a najstabilnije strukture reoptimizirane su kvantnom mehanikom (B3LYP/6-31G* računskim modelom). QTAIM metodom populacijske analize okarakterizirane su vodikove veze u najstabilnijim konformerima te je proučen utjecaj broja aminokiselina i D-manoze kao šećerne komponente na obrasce vodikovih veza uočene u dipeptidu, adamantil-tripeptidu, tetrapeptidu i manoziliranom adamantiltetrapeptidu.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
119-1191342-1339 - Molekulsko modeliranje strukture i reaktivnosti organskih spojeva (Zlatko Mihalić, )
119-1191344-3121 - Sinteze i enzimske transformacije biološki aktivnih spojeva (Srđanka Tomić-Pisarović, )

Ustanove
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Autor s matičnim brojem:
Marija Paurević, (343073)