Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 613005

SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA GALAKTOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA


Butumović, Anamarija
SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA GALAKTOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA 2012., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


Naslov
SINTEZA I KONFORMACIJSKA ANALIZA GALAKTOZILIRANOG ADAMANTILTETRAPEPTIDA
(SYNTHESIS AND CONFORMATIONAL ANALYSIS OF GALACTOSYLATED ADAMANTYLTETRAPEPTIDE)

Autori
Butumović, Anamarija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.12.2012

Godina
2012

Stranica
82

Mentor
Tomić-Pisarović, Srđanka ; Mihalić, Zlatko

Neposredni voditelj
Ribić, Rosana ; Kodrin, Ivan

Ključne riječi
Muramildipeptid; (adamant-1-il)tripeptid; galaktoza; L-serin; sinteza peptida; vodikove veze; konformacijska analiza; populacijska analiza
(Muramyldipeptide; (adamant-1-yl)tripeptide; galactose; L-serine; peptide synthesis; hydrogen bonds; conformational analysis;)

Sažetak
Muramildipeptid (MDP), N-acetilmuramil-L-alanil-D-izoglutamin (L-Ala-D-isoGln), najmanja je strukturna jedinica peptidoglikana koja pokazuje imunostimulatornu (adjuvantsku) aktivnost. Adamantildesmuramildipeptidi koji na L-Ala-D-isoGln imaju vezanu lipofilnu adamantansku podjedinicu AdGly-L-Ala-D-isoGln, apirogeni su i netoksični spojevi koji pokazuju imunostimulatorno djelovanje u pokusima in vivo. U ovom radu opisana je sinteza i konformacijska analiza novog galaktoziliranog adamantiltetrapeptida, O-β-D-galaktopiranozil-L-seril-D, L-(adamant-1-il)glicil-L-alanil-D-izoglutamina. Prvo je pripravljen racemični Boc-(adamant-1-il)glicin koji je zatim kondenziran s benzilnim esterom L-Ala-D-isoGln. Direktnom metodom glikozilacije iz peracetilirane D-galaktoze i N-[(fluoren-9-il)metoksikarbonil]-L-serina (N-(Fmoc)-L-serina) pripravljen je N-(Fmoc)-O-(2, 3, 4, 6-tetra-O-acetil-β-D-galaktopiranozil)-L-serin. Pripravljen adamantiltripeptid nakon N-deprotekcije konjugiran je s N-Fmoc-O-(2, 3, 4, 6-tetra-O-acetil-β-D-galaktopiranozil)-L-serinom. Konačni produkt, O-β-D-galaktopiranozil-L-seril-D, L-(adamant-1-il)glicil-L-alanil-D-izoglutamin, dobiven je učinkovitim uklanjanjem triju zaštinih skupina (N-Fmoc, acetilni te benzilni ester). U sintezi peptida korištena je karbodiimidna metoda stvaranja peptidne veze uz 1-etil-3-(3'-dimetilaminopropil)karbodiimid hidroklorid (EDC·HCl) kao kondenzacijski reagens i 1-hidroksi-benzotriazol (HOBt) kao pomoćni reagens. Za promjenu biološke (adjuvantske) aktivnosti molekula mogu biti odgovorne promjene u primarnoj strukturi peptida, kao i konformacijske promjene koje utječu na njihovo strukturiranje. Slabe interakcije u peptidima imaju važnu ulogu kod nastajanja sekundarnih struktura poput -zavojnica, -nabranih ploča i okreta. Konformacijskom analizom pronađene su energijski najpovoljnije strukture desmuramildipeptida, (adamant-1-il)tripeptida, L-Ser-L-AdGly-L-Ala-D-isoGln tetrapeptida te O-β-D-Gal-L-Ser-D, L-AdGly-L-Ala-D-isoGln galaktoziliranog adamantiltetrapeptida. Korištena je kombinacija sustavnog pretraživanja konformacijskog prostora molekulskom mehanikom (OPLS_2005 i AMBER* poljima sila), a najstabilnije strukture reoptimizirane su kvantnom mehanikom (B3LYP/6-31G* računskim modelom). QTAIM populacijskom analizom okarakterizirane su vodikove veze u najstabilnijim konformerima te je komentiran utjecaj broja aminokiselina na obrasce vodikovih veza uočene u dipeptidu, adamantiltripeptidu i tetrapeptidu. Isto tako proučen je utjecaj dodatno vezanog šećernog dijela kod galaktoziliranog adamantiltetrapeptida na postojeće obrasce vodikovih veza.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
119-1191342-1339 - Molekulsko modeliranje strukture i reaktivnosti organskih spojeva (Zlatko Mihalić, )
119-1191344-3121 - Sinteze i enzimske transformacije biološki aktivnih spojeva (Srđanka Tomić-Pisarović, )

Ustanove
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb