hrvatski

Molekularna raznolikost hrvatskih lokalnih populacija kupusa (Brassica oleracea L. var. capitata)

U Hrvatskoj kupus (Brassica oleracea L. var. capitata) ima veliku važnost u ishrani stanovništva. Po površinama na kojima se uzgaja, kupus je kod nas na samom vrhu među povrćarskim kulturama. Varijabilnost hrvatskih lokalnih populacija i njihova genetska povezanost do danas je malo proučavana. Cilj istraživanja je bio proučiti varijabilnost između i unutar lokalnih populacija kupusa AFLP-molekularnim markerima. Proučavane su četiri lokalne populacije kupusa, tri iz Hrvatske ('Varaždinski', 'Ogulinski' i 'Gerovski') i jedna iz Slovenije ('Kranjska okrugla'), pomoću AFLP- molekularnih markera za čiju su provedbu korištene tri kombinacije polimorfnih početnica. Svaka populacija bila je zastupljena sa po 20 individua. Umnoženi produkti AFLP razdvojeni su kapilarnom elektroforezom Genetic Analyzer 3130 i očitani su programom Gene Mapper ver. 4.0. Izračun matrice sličnosti po Dice-u, UPGMA klaster- i bootstrap-analiza provedena je statističkim programom NTSYSpc 2.21L, a analiza molekularne varijance (AMOVA) je provedena programskim paketom Arlequin ver. 3.1. UPGMA klaster analiza pokazala je jasno grupiranje proučavanih populacija kupusa. Prosječna vrijednost genetske sličnosti između populacija iznosila je 0, 51. Najmanje variranje između individua unutar populacije utvrđeno je kod 'Varaždinskog' kupusa, dok je najveće variranje utvrđeno kod 'Kranjske okrugle'. Analizom molekularne varijance utvrđena je značajna varijabilnost između proučavanih populacija (φST=0, 63 ; p<0, 001). Najveća međupopulacijska udaljenost (FST) utvrđena je između 'Kranjske okrugle' i 'Gerovskog' kupusa (74 %), dok je najmanja međupopulacijska udaljenost utvrđena između 'Ogulinskog' i 'Varaždinskog' kupusa (21%).

kupus ; lokalna populacija ; varijabilnost ; AFLP ; AMOVA

nije evidentirano