hrvatski

Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrste Quecus robur (L.) i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch)

Biljke, kao sesilni organizmi koji ne mogu izbjeći stres, razvile su efikasne kratkoročne strategije za adaptaciju na promjene u okolišu koje se najviše odnose na brze promjene u ekspresiji gena putem epigenetičkih mehanizama. U ovom diplomskom radu istraživane su epigenetičke promjene u dvije vrste, hrastu lužnjaku i bosanskom ljiljanu, i to u populacijama trajno izloženim abiotičkom stresu uslijed promjena staništa. Upotrebom metode CRED-RA (Coupled Restriciton Enzyme Digestion-Random Amplification) analizirana je razina ukupne genomske metilacije DNA te metilacije specifičnog rDNA genomskog područja. U genomu bosanskog ljiljana, između stresne i kontrolne populacije, utvrđena je značajna razlika u učestalosti polimorfizama nastalih zbog metilacijskih događaja. Zbog izrazito visoke intra-populacijske genetičke varijabilnosti hrasta lužnjaka, metoda CRED-RA se pokazala nedovoljno preciznom za utvrđivanje metilacijskih događaja na populacijskoj razini. Metodom RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), utvrđen je veći broj polimorfizama DNA u genomu populacija izloženih stresu obiju istraživanih vrsta., . Analiza specifične metilacije rDNA genomskog područja otkrila je hipermetiliranost rDNA sustava hrasta lužnjaka. Usporedbom CRED-RA obrasca specifične metilacije i restrikcijske mape za 18S-26S rRNA podjedinicu ove vrste pronađena su 4 hipometilirana mjesta unutar intergenske razmaknice čija je funkcija regulacija transkripcije ovih gena.

CRED-RA; IGS; metilacija; polimorfizam; RAPD

nije evidentirano