Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 547719

Vizualizacija makromolekula


Sović, Ivan
Vizualizacija makromolekula, 2008., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


CROSBI ID: 547719 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Vizualizacija makromolekula
(Visualization of macromolecules)

Autori
Sović, Ivan

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
11.07

Godina
2008

Stranica
49

Mentor
Jeren, Branko

Neposredni voditelj
Šikić, Mile

Ključne riječi
protein; prianjanje; molekula; vizualizacija; prikaz; kalotni model; žičani model; kugle i štapići; povrišina molekule; grid; Marching cubes; rekonstrukcija; CPK; PDB; atom; radijus; aminokiselina; lanac; elevacija; inklinacija
(protein; docking; molecule; visualization; display; calotte model; wireframe model; balls and sticks; grid; Marching cubes; reconstruction; CPK; PDB; atom; radius; amino acid; chain; elevation; inclination)

Sažetak
Brzim razvojem računala te znatnim porastom baze podataka poznatih struktura proteina, svoju veliku primjenu našli su i programi za određivanje prianjanja proteina. U sklopu takvih programa nužno je omogućiti uvid u izgled molekula koje proučavamo. Alat razvijen za ovaj završni rad služi vizualizaciji makromolekula. On omogućuje četiri standardna načina prikaza molekule: kalotni, žičani, model kuglama i štapićima, te prikaz površine molekule. Osim toga, VMol može i rekonstruirati površinu dobivenu sfernim harmonicima. Svi načini prikaza su detaljnije pojayšnjeni u poglavljima ovog završnog rada. Ulazne podatke alat dobiva iz zadane PDB datoteke, i datoteke koja sadrži binarni grid. Osim prikaza molekule, VMol daje i informacije o odabranom atomu, aminokiselini, lancu te sferno-polarnim značajkama površine. Na kraju ovog rada prikazano je i testiranje programa sa različitim ulaznim podatcima, čime se pokazuje ispravnost korištenih postupaka, te demonstriraju mogućnosti VMol-a

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Računarstvo



POVEZANOST RADA


Projekti:
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Jeren, Branko, MZOS ) ( POIROT)
098-1191344-2860 - Proučavanje biomakromolekula računalnim metodama i razvoj novih algoritama (Tomić, Sanja, MZOS ) ( POIROT)

Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Profili:

Avatar Url Ivan Sović (autor)

Avatar Url Mile Šikić (mentor)

Avatar Url Branko Jeren (mentor)

Citiraj ovu publikaciju

Sović, Ivan
Vizualizacija makromolekula, 2008., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
Sović, I. (2008) 'Vizualizacija makromolekula', diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Sovi\'{c}, I.}, year = {2008}, pages = {49}, keywords = {protein, docking, molecule, visualization, display, calotte model, wireframe model, balls and sticks, grid, Marching cubes, reconstruction, CPK, PDB, atom, radius, amino acid, chain, elevation, inclination}, title = {Visualization of macromolecules}, keyword = {protein, docking, molecule, visualization, display, calotte model, wireframe model, balls and sticks, grid, Marching cubes, reconstruction, CPK, PDB, atom, radius, amino acid, chain, elevation, inclination}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font