hrvatski

Analiza sekundarne strukture proteina metodom obrade signala

Kako bi mogli odrediti ulogu i funkciju proteina potrebno je poznavati njegovu sekundarnu strukturu. Budući da su eksperimentalne metode određivanja sekundarne strukture veoma skupe i zahtjevne, sve više se teži unapređenju računalnih metoda za određivanje sekundarne strukture. Jedan način jest poznavajući primarnu strukturu iz nje izlučiti određene značajke i pomoću njih odrediti sekundarnu strukturu. Jedno od bitnih svojstava koje utječe na trodimenzionalnu, a time i na sekundarnu strukturu proteina jest polarnost bočnog lanca aminokiselina koja definira indeks hidrofobnosti aminokiselina. Pomoću tih vrijednosti sekvence aminokiselina se transformiraju u diskretne realne signale nad kojima je moguće vršiti razne transformacije ne bi li se došlo do korisne informacije o sekundarnoj strukturi.

protein; proteinski lanac; sekvenca aminokiselina; polarnost boĉnog lanca aminokiselina; indeks hidrofobnosti aminokiselina; primarna i sekundarna struktura; brza Fourierova transformacija; amplitudni spektar; spektralne mjere; tipovi sekundarne strukture; analiza glavnih komponenti.

nije evidentirano