Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 547002

Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula


Papeš Šokčević, Lidija
Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


CROSBI ID: 547002 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula
(Improved algorithm for selection and validation of best multivariate structure-property molecular models)

Autori
Papeš Šokčević, Lidija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, magistarski rad

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
26.10

Godina
2011

Stranica
72

Mentor
Šikić, Mile ; Lučić, Bono

Ključne riječi
QSAR modeliranje ; multivarijacijska linearna regresija ; izbor deskriptora ; razvoj modela ; statistički parametri ; prilagodba modela ; križna provjera ; vanjska provjera ; topljivost molekula u vodi
(QSAR modeling ; multivariate linear regresion ; selection of descriptors ; model development ; statistical parameters ; model fitting ; cross-validation ; external validation ; water solubility of molecules)

Sažetak
Algoritam za izbor najboljih mogućih multivarijatnih modela (prema koeficijentu korelacije) razvijen je za potrebe primjena u istraživanju lijekova. Realiziran je u programskom jeziku Visual Basic i povezan je s bazom podataka. U radu je istražen odnos između statističkih parametara izračunatih na podacima u postupku prilagodbe na skupu za učenje, križne provjere ispuštanjem određenog postotka podataka skupa za učenje i u postupku predviđanja na vanjskom skupu podataka. Postupak križne provjere u kojem se u svakom koraku izbacuju veći podskupovi podataka pokazuje bolje slaganje s rezultatima dobivenim u predviđanju na vanjskom skupu nego najčešće korišteni postupak križne provjere u kojem se u svakom koraku izbacuje po jedna molekula. Nadalje, slaganje između statističkih parametara izračunatih u postupku prilagodbe na skupu za učenje i odgovarajućih parametara izračunatih u postupcima križnih provjera i na vanjskome skupu, znatno je bolje nego slaganja objavljivana u literaturi. To potvrđuje dobre strane primijenjenog postupka početne eliminacije deskriptora, smanjenja korelacije između deskriptora, postupka modeliranja i primijenjenoga algoritma za izbor modela. Za razliku od uobičajenih postupaka križne provjere koji se rabe u literaturi istražile su se učestalosti pojavljivanja pojedinih deskriptora u najboljim modelima. Na temelju tih analiza načinio se redoslijed važnosti pojedinih deskriptora u najboljim modelima, što je važna informacija pri interpretaciji i uporabi najboljih modela. Dobiveni rezultati i razvijena aplikacija MR_QSAR vrijedan su znanstveni i stručni doprinos području razvoja i primjene računalnih algoritama za modeliranja svojstava i aktivnosti molekula koja se provode u znanstvenim krugovima, u istraživanjima novih lijekova u farmaceutskoj industriji, te u zaštiti okoliša u postupcima procjene toksičnosti molekula.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Računarstvo, Farmacija



POVEZANOST RADA


Projekti:
MZOS-036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Jeren, Branko, MZOS ) ( POIROT)
MZOS-079-0000000-3211 - Odnos strukture i aktivnosti flavonoida (Amić, Dragan, MZOS ) ( POIROT)
MZOS-098-1191344-2860 - Proučavanje biomakromolekula računalnim metodama i razvoj novih algoritama (Tomić, Sanja, MZOS ) ( POIROT)
MZOS-098-1770495-2919 - Razvoj metoda za modeliranje svojstava bioaktivnih molekula i proteina (Lučić, Bono, MZOS ) ( POIROT)

Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb,
Fakultet agrobiotehničkih znanosti Osijek,
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb

Profili:

Avatar Url Mile Šikić (mentor)

Avatar Url Bono Lučić (mentor)

Avatar Url Lidija Papeš Šokčević (autor)

Citiraj ovu publikaciju

Papeš Šokčević, Lidija
Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula, 2011., magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
Papeš Šokčević, L. (2011) 'Poboljšani algoritam za izbor i provjeru kvalitete najboljih multivarijacijskih modela odnosa strukture i svojstava molekula', magistarski rad, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Pape\v{s} \v{S}ok\v{c}evi\'{c}, L.}, year = {2011}, pages = {72}, keywords = {QSAR modeling, multivariate linear regresion, selection of descriptors, model development, statistical parameters, model fitting, cross-validation, external validation, water solubility of molecules}, title = {Improved algorithm for selection and validation of best multivariate structure-property molecular models}, keyword = {QSAR modeling, multivariate linear regresion, selection of descriptors, model development, statistical parameters, model fitting, cross-validation, external validation, water solubility of molecules}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font