Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 542759

Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija


Kušević, Katarina
Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb


Naslov
Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija
(Implementation of algorithm for computing protein interactions)

Autori
Kušević, Katarina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
29.06

Godina
2011

Stranica
30

Mentor
Šikić, Mile

Ključne riječi
Proteini; elektrostatska sila; energija solvatacije; ASA; aminokiseline
(Proteins; electrostatic energy; solvents energy; ASA; amino acids)

Sažetak
Algoritam implementiran ovim radom računa elektrostatsku silu između dvije aminokiseline i energiju solvatacije za pojedinu aminokiselinu. Elektrostatska sila računa se kao zbroj elektrostatskih sila pri međusobnim interakcijama svih atoma određene dvije aminokiseline. Podaci potrebni za računanje dobivaju se učitavanjem PDB datoteka i učitavanjem naboja svakog atoma u određenoj aminokiselini. Za izračun energije solvatacije svi potrebni podaci učitavaju se iz datoteke s vrijednostima površina dostupnih otapalu i potencijalom otapala svake aminokiseline.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Branko Jeren, )
098-1191344-2860 - Proučavanje biomakromolekula računalnim metodama i razvoj novih algoritama (Sanja Tomić, )

Ustanove
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb,
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb