hrvatski

Utjecaj okolišnog stresa na duljinu intergenske razmaknice rRNA gena, metilaciju DNA i glikozilaciju proteina u hrasta lužnjaka i bosanskog ljiljana

Biljke, kao sesilni organizmi koji ne mogu izbjeći stres, imaju razvijene kratkoročne strategije kojima se efikasno adaptiraju na promjene u okolišu. U svrhu identifikacije biljnog odgovora na abiotički stres, ovom disertacijom obuhvaćene su različite komplementarne analize na razini genoma, epigenoma i glikoma. Analize su provedene na vrstama Lilium bosniacum i Quercus robur, koje se razlikuju u sistematskoj poziciji, životnom vijeku, fiziologiji, te u veličini i strukturi genoma. Odabrane su populacije obje vrste izložene kontinuiranom abiotičkom stresu. Analize na razini genoma odnose se na utvrđivanje broja i vrsta dužinskih varijanti intergenske razmaknice (IGS) rRNA gena. U populaciji hrasta lužnjaka izloženoj stresu, utvrđeno je postojanje novih dužinskih varijanti IGS razmaknice, dok u populaciji bosanskog ljiljana izloženoj stresu nije jednoznačno potvrđena prisutnost novih IGS varijanti. Determiniran je molekularni mehanizam nastanka novih IGS varijanti u genomu hrasta lužnjaka tako što je određena molekularna struktura IGS sekvence. Analize na razini epigenoma odnose se na utvrđivanje obrasca globalne genomske CpG metilacije. Između populacije izložene stresu i kontrolne populacije bosanskog ljiljana utvrđena značajna razlika u metilaciji DNA. Zbog izrazito visoke intra-populacijske genetičke varijabilnosti hrasta lužnjka metoda CRED-RA se pokazala nedovoljno preciznom za utvrđivanje metilacijskih događaja na populacijskoj razini. Analize na razini glikoma odnose se na utvrđivanje profila N-glikozilacije proteina u listovima biljaka sa stresnog i kontrolnog staništa obiju vrsta. Usporedbom profila N-glikozilacije, dobivenih HPLC metodom, između biljaka iz kontrolnih populacija i biljaka populacija izloženih stresu utvrđen je porast količine složenih N-glikana u populacijama izloženim stresu u obje istraživanje vrste.

abiotički stres; bosanski ljiljan; hrast lužnjak; intergenska razmaknica rRNA gena; metilacija DNA; N-glikozilacija proteina

nije evidentirano