Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 535550

Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s dvolančanim DNA i RNA


Mikulin, Ivana
Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s dvolančanim DNA i RNA 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


Naslov
Ispitivanje interakcija novih cijaninskih boja s dvolančanim DNA i RNA
(Study of interactions of new cyanine dyes with doublestranded DNA and RNA)

Autori
Mikulin, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27. 09

Godina
2011

Stranica
58

Mentor
Tumir, Lidija-Marija ; Juranović Cindrić, Iva

Ključne riječi
Monometinske cijaninske boje; vezanje na DNA/RNA; fluorescencija; cirkularni dikroizam; apsorbancija
(Monomethine cyanines; DNA/RNA binding; fluorescence; circular dichroism; absorbance)

Sažetak
U okviru ovog diplomskog rada spektroskopski su okarakterizirane vodene otopine cijaninskih boja, spojeva TD5-D4, TD5-D5 i TD5-D6 i ispitana je njihova interakcija s dvolančanim polinukleotidima. Vodene otopine spojeva TD5-D4, TD5-D5 i TD5-D6 imaju UV/Vis spektar u području od 220 nm do 550 nm i velike molarne ekstinkcijske koeficijente, slabi intenzitet fluorescenije spojeva se značajno povećava po dodatku polinukleotida te nemaju CD spektar. Primjenom UV-Vis spektroskopije, fluorimetrije i CD spektroskopije ispitano je kako strukturne razlike u homodimerima monometskih cijaninskih boja poput vrste premosnice ili prisutnost različitih supstituenata na aromatskim prstenovima utječu na njihovu interakciju s dvolančanim polinukleotidima. Spoj TD5-D4 u svojoj strukturi sadži krutu propil-piridinsku premosnicu koja uvjetuje da se spoj interkalira između parova baza dl-DNA i dl-RNA. TD5-D5 i TD5-D6 sadrže fleksibilniju propil-piperidinsku premosnicu zbog čega se vežu u mali utor dl-DNA i to u obliku dimera (TD5-D5) ili monomera (TD5-D6) što je posljedica utjecaja atoma klora koji se javlja na kinolinskoj skupini podjedinice TD5-D6. TD5-D5 i TD5-D6 se aglomeriraju na površinu dl-RNA. Svi nastali komleksi su jako stabilni pri čemu su spojevi pokazali veći afinitet prema dl-DNA nego prema dl-RNA.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
098-0982914-2918 - Dizajn, sinteza i ispitivanje interakcija malih molekula s DNA, RNA i proteinima (Ivo Piantanida, )

Ustanove
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb