Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 527596

Preliminarna analiza cDNA biblioteke endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus


Marić, Martina
Preliminarna analiza cDNA biblioteke endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus 2011., diplomski rad, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb


Naslov
Preliminarna analiza cDNA biblioteke endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus
(Preliminary analysis of cDNA library from endemic stygobitic sponge Eunapius subterraneus)

Autori
Marić, Martina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
16.09

Godina
2011

Stranica
60

Mentor
Ćetković, Helena

Neposredni voditelj
Harcet, Matija ; Pleše, Bruna

Ključne riječi
Eunapius subterraneus; spužva; selenoprotein W; evolucija
(Eunapius subterraneus; endemic sponge; selenoprotein W; evolution)

Sažetak
Spužve (Porifera) su najjednostavnije životinje koje su se prve odvojile od zajedničkog razvojnog stabla Metazoa. Prve sustavne studije gena i genoma spužava pokazale su da spužve imaju kompleksan genom koji je postojao već kod zajedničkog pretka svih životinja (Urmetazoa). Molekularno-genetička karakterizacija i rekonstrukcija filogenije endemične špiljske spužve Eunapius subterraneus isključuju pripadnost ove spužve rodu Eunapius, te ukazuju na postojanje bitne nepodudarnosti klasične taksonomije spužava s onom dobivenom molekularno-genetičkim metodama. Nasumičnim sekvenciranjem cDNA (eng. complementary DNA) biblioteke spužve E. subterraneus stvorena je preliminarna baza EST-ova (eng. expressed sequence tags). Korištenjem niza bioinformatičkih alata EST-ovi su analizirani s ciljem produbljivanja spoznaja o značajkama gena i proteina spužava usporedbom s genima/proteinima drugih organizama. Potvrđena je hipoteza da je složenost genoma svojstvo koje je bilo prisutno već kod zajedničkog pretka svih životinja i da postoji iznenađujuće velika sličnost između proteina spužve i čovjeka. Pretragom cDNA biblioteke izdvojena je kompletna cDNA koja kodira za selenoprotein W. Analiza primarne strukture pokazala je veliku sačuvanost kodirajuće regije i SECIS motiva u nekodirajućoj regiji.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
098-0982913-2874 - Geni i genomi: struktura, funkcija i evolucija (Helena Ćetković, )

Ustanove
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb