Struktura i filogenetička analiza rRNK i tRNK gena slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 (CROSBI ID 575385)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | međunarodna recenzija
Podaci o odgovornosti
Elez, Nikolina ; Pleše, Bruna ; Pojskić, Naris ; Tulić, Una ; Ćetković, Helena ; Lukić-Bilela, Lada
hrvatski
Struktura i filogenetička analiza rRNK i tRNK gena slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758
Spužve (Porifera), bazalno pozicionirane na filogenetskom stablu višestaničnih životinja, predstavljaju izvrstan model za evolutivne studije. Veličina njihovog mitohondrijskog (mt) genoma svojevrstan je intermedijarni stadijum između 76 kbp velikih genoma hoanoflagelata (Burger et al., 2003) i tipičnih mt genoma bilateralnih životinja, te su stoga pogodne za rekonstruiranje ranih odnosa u molekularno-evolutivnoj mitohondrijskoj genomici. U ovome radu analizirana je, gotovo cjelovita, mitohondrijska DNK (mtDNK) slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 (Spongillidae Gray, 1867). Cirkularni mitohondrijski genom, dužine približno 28, 080 bp, sadrži 22 gena za transportne RNK (tRNK) nađena i u mtDNK drugih spužava te 2 dodatna tRNK gena (trnR2(ucu), trnMe(cau)), 2 gena za ribozomalne RNK (rRNK) slične bakterijskim te 14 protein-kodirajućih gena, uključujući gen za podjedinicu 9 (atp9) ATP-sintaze, . Usporedba mtDNK iz S. lacustris s drugim mt genomima upućuje na kompaktnu genomsku arhitekturu, nepostojanje introna i konzerviran raspored gena uz minimalno izmijenjen genetički kod. Nadalje, filogenetička analiza rRNK i tRNK gena pokazuje najveću homologiju s predstavnicima porodice Spongillidae, osobito s klasterom Eunapius subterraneus-Lubomirskia baikalensis-Ephydatia muelleri. Mitohondrijski genom S. lacustris pokazuje svojstva ancestralnih, ali i tipičnih animalnih karakteristika koje su odlika i drugih mt genoma unutar razreda Demospongiae.
Porifera; Spongilla lacustris; mitohondrijska DNA; rRNA; tRNA
nije evidentirano
engleski
Structure and Phylogenetic Analysis of Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 rRNAs and tRNAs Genes
nije evidentirano
Porifera; Spongilla lacustris; mitochondrial DNA; rRNA; tRNA
nije evidentirano
Podaci o prilogu
16-17.
2011.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Knjiga sažetaka
Sulejman Redžić
Sarajevo: Akademija nauka i umjetosti Bosne i Hercegovine (ANUBiH)
Podaci o skupu
Međunarodni naučni Skup "Struktura i dinamika ekosistema Dinarida (stanje, mogucnosti i perspektive)
predavanje
15.06.2011-16.06.2011
Sarajevo, Bosna i Hercegovina