Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 525621

Struktura i filogenetička analiza rRNK i tRNK gena slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758


Elez, Nikolina; Pleše, Bruna; Pojskić, Naris; Tulić, Una; Ćetković, Helena; Lukić-Bilela, Lada
Struktura i filogenetička analiza rRNK i tRNK gena slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 // Knjiga sažetaka / Sulejman Redžić (ur.).
Sarajevo: Akademija nauka i umjetnosti Bosne i Hercegovine, 2011. str. 16-17 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)


Naslov
Struktura i filogenetička analiza rRNK i tRNK gena slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758
(Structure and Phylogenetic Analysis of Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 rRNAs and tRNAs Genes)

Autori
Elez, Nikolina ; Pleše, Bruna ; Pojskić, Naris ; Tulić, Una ; Ćetković, Helena ; Lukić-Bilela, Lada

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Knjiga sažetaka / Sulejman Redžić - Sarajevo : Akademija nauka i umjetnosti Bosne i Hercegovine, 2011, 16-17

Skup
Međunarodni naučni Skup "Struktura i dinamika ekosistema Dinarida (stanje, mogucnosti i perspektive)

Mjesto i datum
Sarajevo, Bosna i Hercegovina, 15-16.06.2011

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija

Ključne riječi
Porifera; Spongilla lacustris; mitohondrijska DNA; rRNA; tRNA
(Porifera; Spongilla lacustris; mitochondrial DNA; rRNA; tRNA)

Sažetak
Spužve (Porifera), bazalno pozicionirane na filogenetskom stablu višestaničnih životinja, predstavljaju izvrstan model za evolutivne studije. Veličina njihovog mitohondrijskog (mt) genoma svojevrstan je intermedijarni stadijum između 76 kbp velikih genoma hoanoflagelata (Burger et al., 2003) i tipičnih mt genoma bilateralnih životinja, te su stoga pogodne za rekonstruiranje ranih odnosa u molekularno-evolutivnoj mitohondrijskoj genomici. U ovome radu analizirana je, gotovo cjelovita, mitohondrijska DNK (mtDNK) slatkovodne spužve Spongilla lacustris Linnaeus, 1758 (Spongillidae Gray, 1867). Cirkularni mitohondrijski genom, dužine približno 28, 080 bp, sadrži 22 gena za transportne RNK (tRNK) nađena i u mtDNK drugih spužava te 2 dodatna tRNK gena (trnR2(ucu), trnMe(cau)), 2 gena za ribozomalne RNK (rRNK) slične bakterijskim te 14 protein-kodirajućih gena, uključujući gen za podjedinicu 9 (atp9) ATP-sintaze, . Usporedba mtDNK iz S. lacustris s drugim mt genomima upućuje na kompaktnu genomsku arhitekturu, nepostojanje introna i konzerviran raspored gena uz minimalno izmijenjen genetički kod. Nadalje, filogenetička analiza rRNK i tRNK gena pokazuje najveću homologiju s predstavnicima porodice Spongillidae, osobito s klasterom Eunapius subterraneus-Lubomirskia baikalensis-Ephydatia muelleri. Mitohondrijski genom S. lacustris pokazuje svojstva ancestralnih, ali i tipičnih animalnih karakteristika koje su odlika i drugih mt genoma unutar razreda Demospongiae.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija



POVEZANOST RADA


Projekt / tema
098-0982913-2874 - Geni i genomi: struktura, funkcija i evolucija (Helena Ćetković, )

Ustanove
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb