Genetička osnova multirezistencije sojeva Mycobacterium tuberculosis izoliranih u Hrvatskoj (CROSBI ID 365657)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Obrovac, Mihaela
Grce, Magdalena
hrvatski
Genetička osnova multirezistencije sojeva Mycobacterium tuberculosis izoliranih u Hrvatskoj
Mycobacterium (M.) tuberculosis, najčešće dokazani bakterijski uzročnik zaraznih bolesti u svijetu, godišnje uzrokuje smrt oko tri milijuna ljudi. Poseban problem predstavlja multirezistentna tuberkuloza, rezistentna najmanje na rifampicin i izoniazid. Cilj je ovog istraživanja bio provjeriti postoje li u Hrvatskoj sojevi M. tuberculosis, osjetljivi na antituberkulotske lijekove, a identičnog genotipa kao i neki od 79 multirezistentnih sojeva izoliranih od 1999. do 2010. godine. Sojevi su genotipizirani određivanjem broja ponavljanja sekvenci karakterističnih za M. tuberculosis, metodom MIRU-VNTR (engl. Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number of Tandem Repeats). Prvu razinu genotipizacije čini određivanje broja ponavljanja 15 MIRU-VNTR lokusa, a drugu određivanje dodatnih 9 lokusa. Iz nacionalne baze genotipova M. tuberculosis izdvojeno je 135 sojeva M. tuberculosis koji nisu mulitrezistentni, a 15-članim genotipom su identični nekom od multirezistentnih sojeva. Uz 15 multirezistentnih sojeva jedinstvenog genotipa, preostalih 64 podijeljeno je u 25 klastera veličine 2 do 49 članova gdje je najmanje jedan soj multirezistentan. Za rezistentne sojeve određena je molekularna osnova rezistencije na rifampicin i izoniazid ispitivanjem mutacija u genima rpoB, katG i inhA. Svi ispitivani sojevi pripadaju modernim sojevima M. tuberculosis jer je u svima potvrđena delecija regije TbD1. Udio filogenetskih obitelji M. tuberculosis određen je usporedbom rezultata genotipizacije s referentnim sojevima u mrežnoj bazi podataka MIRU-VNTRplus, a u promatranoj populaciji sojeva najčešći su bili sojevi koji pripadaju obitelji Haarlem.
tuberkuloza; multirezistencija; genotipizacija; metoda MIRU-VNTR
Eksperimentalni dio ovog rada je izrađen na Odjelu za dijagnostiku tuberkuloze Službe za mikrobiologiju Hrvatskog zavoda za javno zdravstvo.
engleski
Genetic basis of multiresistance in Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Croatia
nije evidentirano
tuberculosis; multiresistance; genotyping; MIRU-VNTR method
nije evidentirano
Podaci o izdanju
111
15.07.2011.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb