hrvatski

Položaji nukleosoma na satelitnoj DNA vrste Tenebrio molitor

Analiziran je raspored nukleosoma na satelitnoj DNA kornjaša Tenebrio molitor (Tenebrionidae, Coleoptera). Jedna satelitna porodica čini približno polovicu genomske DNA ove vrste. Nakon razgradnje sirovog kromatinskog ekstrakta s mikrokokalnom nukleazom dobivena je vrlo pravilna nukleosomska ljestivica sastavljena od multimera osnovne duljine oko 170 pb. Ljestvica fragmenata je u potpunosti hibridizirala sa sondom pripremljenom od satelitne DNA, ukazujući time na jednoliku razdiobu nukleosoma koji sadrže satelitne jedinice ponavljanja u razgrađenom materijalu. Od ukupne količine fragmenata dobivenim kloniranjem, određen je nukleotidni slijed onima koji su reagirali pozitivno u hibridizacijskoj reakciji. Analiza sekvenci ukazuje da je mikrokokalna nukleaza preferencijalno pocijepala specifična, nukleotidnom sekvencom definirana mjesta, predvidivo bez obzira na nukleosomski položaj. Dobiveni rezultat mogao bi biti posljedica neuobičajeno gustog pakiranja nukleosoma u heterokromatinu kukca T. molitor zbog mogućih dodatnih, čvrsto vezanih proteinskih komponentata koje ostaju vezane tijekom procedure izolacije. Da bi se izbjegao taj problem, u tijeku su eksperimenti izolacije kromatina iz jezgri i cijepanja s mikrokokalnom nukleazom, egzonukleazom III i nukleazom S1, u svrhu dobivanja samo onih odsječaka DNA koji su obavijeni oko nukleosoma.

kromatin; satelitna DNA; nukleosom; mikrokokalna nukleaza

nije evidentirano