hrvatski

Računalno istraživanje kiselinsko-baznih svojstava alfa-aminokiselina u vodenim otopinama

Kiselinsko-bazna svojstva 22 prirodne alfa- aminokiseline u vodenim otopinama istraživana su razmatranjem reakcija prijenosa protona u vodi primjenom računalnih metoda. Izračunane su obje konstante disocijacije za hidrofilne i hidrofobne aminokiseline te tri konstante disocijacije za aminokiseline koje sadrže kiselu ili bazičnu skupinu na bočnom ogranku. Pri tome su korištena tri koncepcijski potpuno različita računalna modela - COSMO-RS, COSMO i klaster-kontinuum model. Unutar ovog posljednjeg koriste se strukture grozdova s nekoliko molekula vode, određene u plinskoj fazi. Izvorni klaster- kontinuum model nije se mogao primjeniti na aminokiseline. Stoga je u ovom radu za računanje konstanti disocijacije aminokiselina po prvi puta predložen i primjenjen princip izodezmičkih reakcija, koje imaju sačuvan broj vodikovih veza s molekulama vode. Dana je usporedba dobivenih konstanti s eksperimentalnim vrijednostima za sva tri modela. Izračunane vrijednosti su u dobrom slaganju s mjerenjima, ako se uzme u obzir kompleksnost problema.

aminokiseline ; COSMO ; COSMO-RS ; izodezmička reakcija ; klaster-kontinuum model ; pKa ; vodikove veze

nije evidentirano