hrvatski

QSAR ANALIZA INHIBITORA hERG KALIJEVIH KANALA

Kalijevi kanali imaju vrlo važnu ulogu u podražljivosti i regulaciji trajanja akcijskog potencijala. U skupinu kalijevih kanala ovisnih o naponu pripadaju hERG kanali (engl. the human Ether-à-go-go Related Gene), podvrsta važna za provodljivost impulsa u srcu. hERG kanali predstavljaju mete III klase antiaritmika (amiodaron, sotalol) koji reduciraju rizik od aritmija prolongiranjem trajanja akcijskog potencijala i refraktornog perioda. Drugim lijekovima hERG predstavlja nehotičnu metu što dovodi do nuspojava (npr. produženje Q-T intervala, iznenadna smrt) zbog čega je provjera inhibicije hERG kanala dio pretkliničkih ispitivanja. Cilj ovog rada je odabrati molekulske deskriptore odgovorne za inhibiciju hERG kanala. Podaci o biološkoj aktivnosti preuzeti su iz baze Katsumi Yoshide i Tomoko Niwe koja sadrži 76 molekula [1]. Za izračunavanje molekulskih deskriptora (relativna molekulska masa - Mr, molarni volumen, broj donora - Hbd i akceptora - Hba, vodikovih veza, log P, ukupna polarna površina molekule - TPSA, polarizabilnost, molarna refrakcija, topološki indeksi – Randićev indeks, Balabanov indeks, Wienerov broj, Hararijev indeks, Schultzov indeks) korišteni su programi ACD/ChemSketch Freeware (Advanced Chemistry Development, Inc., SAD), ChemFileBrowser (Hyleos, SAD). Matematičko modeliranje provedeno je metodom multiple regresije i metodom slučajnih šuma koristeći program R (R Foundation, Austrija). Kao deskriptori značajni za inhibitorni učinak odabranih spojeva dobiveni su relativna molekulska masa, TPSA, Hba i Hbd, te log P. Temeljem dobivenih rezultata idealni inhibitor hERG kanala trebao bi imati relativnu molekulsku masu između 400 i 500, malu polarnu površinu (TPSA = 20-50 Å2), mali broj HBa i HBd i log P oko 5.

QSAR; hERG inhibitori

nije evidentirano