engleski

Analysis of proteins and peptides by mass spectrometry

Proteini su molekularni efektori bioloških procesa te su stoga direktno uključeni u patogenezu bolesti. Identifikacija proteina vezanih uz određena oboljenja prvi je korak ka razumijevanju bolesti, ali i ka razvoju potencijalnog lijeka. Današnje metode sistemskog pristupa analize proteomskog profila (proteomika) omogućava istovremeno praćenje čak nekoliko tisuća različitih proteina i njihovih izoformi. Zbog globalnog uvida u sastav i količinu proteina, te zbog male količine uzorka potrebnog za analizu, proteomika je pronašla svoju primjenu u kliničkim i biomedicinskim istraživanjima. Ključni korak u analizi proteoma je odjeljivanje proteina za što se koristi dvodimenzionalna elektroforeza u gelu (skr. 2D gel elektroforeza) i razdvajanje tekućinskom kromatografijom (skr. LC, od eng. Liquid Chromatography). Sama identifikacija proteinskih biomarkera uglavnom se provodi nekom od tehnika spektrometrije masa uz upotrebu različitih analizatora (analizator vremena leta ; engl. time of flight, TOF, tandemni spektrometri masa: MS/MS, QQQ, MS/Q, Q/TOF, kvadrupol ; skr. Q i dr.), nakon čega se pristupa pretraživanju proteinskih baza podataka. U korak sa svjetskim znanstvenim trendovima, u okviru Instituta “Ruđer Bošković” u Zagrebu za potrebe cjelokupne hrvatske znanstvene zajednice osnovan je Centar za proteomiku i spektrometriju masa, čija je primarna djelatnost uvođenje i razvoj novih metoda proteomike u istraživanju različitih poremećaja u ljudi. Na Institutu “Ruđer Boškoviċ”, ali i u drugim hrvatskim i regionalnim znanstvenim institucijama u tijeku su deseci projekata vezanih za razumijevanje nastanka raznih bolesti (npr. karcinoma prostate, dupytrenove kontrakture i sl.) kao i za praćenje mehanizma djelovanja lijekova na određene biomarkere. Analize koje uključuju identifikaciju i pronalazak biomarkera, nužne su za rad i razvoj u okviru više hrvatskih znanstvenih projekata. Budući da nigdje drugdje u Republici Hrvatskoj ne postoji adekvatna instrumentacija, analize biomarkera na visokofrekventnoj osnovi analiza kao proteomska podrška medicinskim i biološkim istraživanjima se gotovo isključivo izvode u našem laboratoriju (Laboratorij za sistemsku biomedicinu, Zavod za molekularnu medicinu, Institut “Ruđer Boškoviċ”) koji surađujući sa dolje navedenim međunarodnim ustanovama pokušava suvremenu tehnologiju proteomike staviti na raspolaganje hrvatskim znanstvenicima.

mass spectrometry; biomarkers; molecular mechanisms of disease

Objavljivanje rada (poglavlja u knjizi) u Radu Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti, Medicinske znanosti je u postupku izdavanja.