hrvatski

Struktura i organizacija subtelomerne satelitske porodice JMH2 u vrsti Anemone hortensis L. (Ranunculaceae)

Genomi biljaka sadrže velike količine uzastopno ponavljajuće (satelitske) i raspršene DNA koje se razlikuju u slijedu nukleotida, položaju na kromosomima i zastupljenosti u genomu. U ovom istraživanju karakterizirana je JMH2 satelitska porodica osnovne jedinice ponavljanja duljine od 743 bp (HindIII fragment) u vrsti Anemone hortensis L. (2n=16), te joj je određena primarna struktura i kromosomska organizacija. Osnovna jedinica ponavljanja JMH2 satelitske porodice sadrži biljna (Arabidopsis) telomerna ponavljanja (T3AG3)5, animanlna telomerna ponavljanja (T2AG3)2 i degenerirane telomerne sljedove ukupne duljine 91bp. Stupanj homologije JMH2 sekvenca unutar Anemone hortensis je 78 do 93%, a utvrđena je i varijabilna regija u području između nukleotida 210 i 290 unutar kojeg se nalazi najdulji neprekinuti slijed telomernih ponavljanja duljine 64bp. Fluorescencijskom hibridizacijom in situ utvđena je kolokalizacija JMH2 satelitske porodice sa subterminalnim heterokromatinskim blokovima smještenim na dužem kraku metafaznih kromosoma 1, 2, 3, 4 i 5. Obzirom na položaj na kromosomima JMH2 porodica pripada skupini subtelomernih uzastopno ponavljajućih DNA porodica. Također je potvrđeno da heteromorfnost submetacentričnog para 4 utvrđena na razini heterokromatina odgovara prisutnosti/odsutnosti subtelomerne JMH2 porodice. Nadalje, JMH2 porodica utvrđena je i u drugim vrstama roda Anemone kao i srodnih rodova Pulsatilla i Hepatica. Filogenetska analiza pokazala je da subtelomerna JMH2 porodica nije dobar molekularni biljeg za istraživanje evolucijskih odnosa vrsta unutar roda Anemone i istraživanih srodnih rodova.

Anemone; satelitska DNA; subtelomerna ponavljanja; fluorescencijska hibridizacija in situ

nije evidentirano