hrvatski

Karakterizacija autohtonih sojeva Rhizobium leguminosarum biovar viciae efikasnih u nodulaciji biljaka domaćina

Analizirana su dva autohtona soja R. leguminosarum bv. viciae, nazvana 201ZG i 301ZG. Prethodno su izolirana iz korjenovih kvržica graška i grahorice, gdje ove simbiozne bakterije reduciraju (fiksiraju) dušik iz atmosfere i prevode ga u amonijak. Uspostavljanje simbiznog odnosa odvija se u nekoliko koraka, a u ranim fazama nodulacije uključeni su regulatorni gen nodD i inducibilni geni nodABC i nodFEL. U našim su analizama bili uključeni najznačajniji nodulacijski geni nodA i nodD, kao i glavna promotorska regija smještena između tih gena. U prethodnim su istraživanjima uočene brojne promjene u restrikcijskim mapama te regije, a u ovom smo radu željeli točno utvrditi kompletnu primarnu strukturu gena nodA, nodD i promotora, te uočene mutacije dovesti u svezu s biološkim svojstvima autohtonih sojeva putem biološkog pokusa u stakleniku. Regija plazmida pRL1JI koja obuhvaća nodA i nodD gene, te promotorsku regiju među njima, amplificirana je lančanom reakcijom polimerazom (PCR), a potom klonirana i sekvencirana. Rezultati su pokazali mnogobrojne promjene u primarnoj strukturi i gena i promotora u oba autohtona soja. Primarne strukture proteina NodA i NodD su vrlo sačuvane (promijenjenih aminokiselina je 2.0% u nodA kod soja 201ZG, a 6.6% kod soja 301ZG ; 3.2% u nodD kod soja 201ZG, a 3.6% kod soja 301ZG). U promotorima je sačuvan slijed nod boxa koji je neophodan za funkciju samog promotora. Biološki pokus ukazao je na znatno bolju efikasnost nodulacije autohtonih sojeva u odnosu na kontrolni soj, što je, pretpostavljamo, barem djelomično u svezi s uočenim molekularno genetičkim karakteristikama autohtonih sojeva. Rezultati dobiveni mjerenjem količine ukupnog i amidnog dušika u nadzemnoj biljci ukazuju i na vrlo veliku efektivnosti sojeva u procesu fiksacije dušika.

simbioza; fiksacija dušika; nodulacija; Rhizobium leguminosarum bv. viciae; nodA i nodD

nije evidentirano