hrvatski

Računalna analiza mogućih funkcionalnih efekata novih neklasificiranih nukleotidnih promjena gena BRCA1 i BRCA2 pronađenih u zdravih žena u Hrvatskoj

Geni BRCA1 i BRCA2 su glavni geni odgovorni za nastanak nasljednog oblika raka dojke i jajnika. Nositelji mutacija u tim genima imaju povećani rizik obolijevanja od različitih vrste raka. Polovica do sada pronađenih nukleotidnih promjena gena BRCA1 i BRCA2 su neklasificirane varijante, što znači da je njihov klinički značaj nepoznat ili nepouzdan. To stvara problem kod genetskog savjetovanja u procijeni rizika obolijevanja. Prvi u Hrvatskoj, razvili smo metodu za otkrivanje nasljedne sklonosti raku dojke i jajnika te analizirali sve nukleotidne promjene gena BRCA1 i BRCA2 u 220 zdravih žena u Hrvatskoj. Koristeći računalne metode pokušali smo odrediti neklasificirane varijante koje bi mogle imati štetan učinak na intronsko ili egzonsko prekrajanje mRNA, na strukturu i funkciju proteina te na funkcionalne domene proteina. Upotrebom nekoliko internet-baziranih alata utvrdili smo da dvije pogrešne zamjene aminokiselina i delecija jedne aminokiseline vjerojatno nemaju štetan učinak na strukturu i funkciju BRCA2 proteina. Dvije istovjetne zamjene aminokiselina mogle bi imati učinak na prekrajanje mRNA promjenom egzonskih pojačivača prekrajanja dok jedina intronska promjena nema utjecaja na prekrajanje mRNA. Ni sve druge promjene u egzonima ne dovode do stvaranja novih mjesta prekrajanja. Računalna analiza je brz i jeftin način preliminarnog određivanja kliničkog značaja neke promjene gena kada su potrebni skupi laboratorijski testovi za utvrđivanje funkcionalnog značaja te promjene.

BRCA1&2 ; rak dojke ; polimorfizmi ; mutacije ; Hrvatska

nije evidentirano