hrvatski

Organizacija i evolucija ponavljajućih DNA u vrsta roda Anemone (Ranunculaceae)

Kariotip vrste Anemone hortensis L (2n=2x=16) sastoji se od tri akrocentrična, jednog meta-submetacentričnog i četiri metacentrična kromosoma. Dva lokusa za 18S-5.8S-26S (18S-26S) rDNA nalaze se na satelitu i sekundarnom suženju akrocentričnog kromosomskog para 2 te telomerno na kraćem kraku akrocentričnog kromosomskog para 3, dok se dva 5S rDNA lokusa nalaze pericetromerno na kraćem kraku meta-submetacentričnog kromosomskog para 4 te na kraćem kraku akrocentričnog kromosomskog para 2 u blizini 18S-26S rDNA lokusa. Bojanje fluorokromima kromomicinom A3 otkriveno je da su 18S-26S lokusi jedina heterokromatinska područja bogata parovima baza G-C, dok se heterokromatin bogat parovima baza A-T, otkriven bojom 4, 6-diamino-2-fenilindol (DAPI), nalazi interkalarno i terminalno na dužim krakovima svih akrocentričnih kromosoma te terminalno na kromosomima 4 i 5. Telomere vrste A. hortensis sastoje se od biljnog Arabidopsis-tipa telomernih ponavljanja (T3AG3)n. Dvije porodice uzastopno ponavljajućih sljedova DNA (JME i JMH2) i jedna raspršena porodica (JMH1) klonirane su i opisane po prvi put u vrsti Anemone hortensis L. s obzirom na organizaciju, položaj na kromosomima te rasprostranjenost unutar roda Anemone i njemu srodnih rodova Hepatica i Pulsatilla. Obje satelitske porodice pokrivaju sva DAPI-pozitivna heterokromatinska područja vrste A. hortensis. Meta-submetacentrični kromosomski par pokazao je polimorfizam s obzirom na prisutnost JMH2 i telomernog signala Arabidopsis-tipa (T3AG3)n. Porodica JMH1, jedinice ponavljanja od  945 pb, pokazala je raspršeni razmještaj na svim kromosomima vrste A. hortensis. Pretraživanje banke gena pokazalo je da porodica JMH1 ima djelomičnu sličnost s retrotranspozonom iz skupine Ty3/gypsy. Uzastopne ponavljajuće porodice JMH2 i JME zauzimaju 0, 74% i 0, 03%, dok raspršena porodica JMH1 zauzima 8, 77% genoma vrste A. hortensis. Upotrebom metoda PCR i hibridizacije prema Southernu utvrđeno je da je porodica JMH2 prisutna u rodovima Anemone, Hepatica i Pulsatilla, dok je porodica JMH1 prisutna u rodovima Anemone i Hepatica, a odsutna u rodu Pulsatilla. Porodica JME specifična je samo za rod Anemone. Od svih analiziranih porodica ponavljajuće DNA jedino porodica JMH1 može se upotrijebiti kao molekularni biljeg u filogenetskim istraživanjima.

Anemone sp.; evolucija; filogenija; kariotip; retrotranspozon; satelitska DNA

nije evidentirano